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Não sei se é isso que VC quer, mas VC pode colocar tudo em uma tabela, identificando apenas pelo Pai assim VC poder ter quantos níveis quiser.
Não sei se fui claro, mas se tiver dúvida posta aí.
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Já trabalhei com um banco que tem mais de um milhão de registros, indexados e nunca tive problemas
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