bioconductor镜像可以在linux系统下正常使用安装R包,在windows系统下用不了

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xing zihao

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Dec 28, 2023, 6:15:18 AM12/28/23
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bioconductor镜像可以在linux系统下正常使用安装R包,在windows系统下用不了

BiocManager::install()默认会找src/contrib下的R包,Index of /bioconductor/3.18/bioc/src/contrib/ | 清华大学开源软件镜像站 | Tsinghua Open Source Mirror 下有tar.gz包课可以在Linux上安装,
Index of /bioconductor/3.18/bioc/bin/windows/contrib/4.3/ | 清华大学开源软件镜像站 | Tsinghua Open Source Mirror下有包,但是连接中没有src,被BiocManager::instal识别不了,这个问题希望能解决一下


Miao Wang

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Dec 28, 2023, 9:31:46 AM12/28/23
to tuna-g...@googlegroups.com
您好,

感谢您致信 TUNA。

TUNA 镜像站上的 bioconductor 中的内容和上游一致。您提及的 bioc/src/contrib 目录,存储的是软件包的源代码;bioc/bin 目录下存储的是编译后的二进制文件,其中 bioc/bin/windows 目录下存储的是为 Windows 平台编译的二进制文件。因此,bioc/bin/windows/contrib/4.3 下不会有 src 目录。

如果您对 bioconductor 使用有疑问,建议您阅读该软件的手册和帮助文档,或向其开发者询问。

祝好,

Miao Wang
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xing zihao

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Dec 28, 2023, 9:56:26 AM12/28/23
to TUNA 主邮件列表
您好,麻烦你尝试一下在windows系统下使用BiocManager::install()和bioconductor的清华源镜像随便安装一个bioconductor的包看能不能下载安装成功,如果能安装成功的话,麻烦给我发一下您的安装命令,我这边使用清华源的镜像,老是说下载不了Bioconduto上的包,谢谢了

Miao Wang

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Dec 28, 2023, 9:58:35 AM12/28/23
to tuna-g...@googlegroups.com
您好,

我个人不使用 bioconductor 和 windows 系统。您可以详细描述您想要进行的任务、执行的操作、期待的结果和实际发生的现象,看邮件列表里是否有其他有经验的用户能解答您的问题。

祝好,

Miao Wang
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xing zihao

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Dec 28, 2023, 6:47:53 PM12/28/23
to TUNA 主邮件列表
哦哦,我现在可以正常安装了,我添加镜像的时候把路径加上一个bin/就能识别到windows的软件包了
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