Boa tarde
Tudo normal no processamento dos RPS com Tomador CNPJ.
Favor verificar se seu sistema está montando o XML conforme o layout esperado.
<Tomador>
<IdentificacaoTomador>
<CpfCnpj>
<Cnpj></Cnpj>
</CpfCnpj>
<InscricaoMunicipal></InscricaoMunicipal>
</IdentificacaoTomador>
<RazaoSocial></RazaoSocial>
<Endereco>
<Endereco></Endereco>
<Numero></Numero>
<Bairro></Bairro>
<CodigoMunicipio></CodigoMunicipio>
<Uf></Uf>
<CodigoPais></CodigoPais>
<Cep></Cep>
</Endereco>
<Contato>
<Telefone></Telefone>
<Email></Email>
</Contato>
</Tomador>
Se o bloco do Tomador estiver montado errado ou tags com o nome diferente do layout, pode gerar Tomador Não Identificado no layout impresso da Nota.