[VBMEG-users:00151] .eeg.matの電極座標の座標系

[shibusawa]

VBMEG-Users
ご担当者様

初めて投稿させて頂きます。
慶應義塾大学学部四年の澁澤と申します。

私はEEGデータの電流源推定にVBMEGを使用した解析を考えております。
そこで、EEGフォーマットに従って.eeg.matファイルを作成しようと思うのですが、脳波測定電極の位置座標情報はどの座標系のものを使用したらよろしいのでしょうか。
具体的には、nasion座標系で取得した位置座標情報をMNI座標系に変換する必要があるのか分からずにいます。

宜しくお願い致します。

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慶應義塾大学理工学部
生命情報学科牛場研究室
学部四年　澁澤柊花
shib...@brain.bio.keio.ac.jp
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[Ryosuke Hayashi]

澁澤様

ATRの林です。ご質問ありがとうございます。
EEGの電極の位置情報ですが、被験者の構造画像上での電極位置が必要になります。
具体的には、
・原点：画像中心
・右手座標系(X: Left -> Right Y: Posterior -> Anterior Z: Inferior -> Superior)
・単位：メートル
です。

位置計測装置を用いて、特徴点(Nasion, LPA, RPA)と電極位置を取得されたことと思います。
その座標値を被験者の構造画像上に、特徴点を使って位置あわせを行う必要があります。
そのためのソフトウェアをご用意しております。

■ご用意いただくもの
1.MRI構造画像
Analyze形式を使用します。VBMEGを用いて変換します。
DICOM画像を変換して下さい。変換方法は以下をご参照下さい。
（LAS_で始まる.hdr/.imgファイルです）
MR image preprocessing (DICOM to ANALYZE, bias correction)
http://vbmeg.atr.jp/docs/manual/manual_e.html#toc5
2.位置あわせソフトウェア
http://vbmeg.atr.jp/#DOWNLOAD
・位置合わせソフト（マニュアル同梱）（7MB）
をダウンロードして下さい。
3.特徴点およびEEG電極位置座標を収めたファイル(単位：mm)
・最初の３点はLPA,RPA,Nasionの順とし、その後の行は電極位置です
-48.4125 -45.5572 -15.1370
-5.6138 -196.2200 -9.9679
70.5699 -93.8458 -4.8861
62.7599 -64.9985 59.5875
75.6729 -92.7912 60.6734
76.7122 -122.3976 60.9182
35.6883 -42.1739 57.1087
…
4.EEGラベルファイル
・以下のような１行１電極名を記載したファイルを用意して下さい(特徴点名は入れません)
Fp1
Fpz
Fp2
AF7
AF3
AFz
AF4
AF8
F7

■位置あわせマニュアル
位置あわせソフトのdoc/EEG_positioning_manual_fastscan2_0.doc
を参考にして下さい。
なお、
4-4.Stylusファイル、VRMLファイルを指定する
のVRMLファイルは指定しなくても結構です。

■位置あわせ結果ファイル
・POS－MATファイル(.pos.mat)が出力されます。
この中の、
・pos <Nx3 double>
・name<Nx1 cell>
がそれぞれ、位置あわせ後の座標、電極名となります。
これを、.eeg.matファイルの作成にご使用下さい。

またご不明な点がありましたら、ご連絡下さい。
以上、よろしくお願い致します。

林

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ATR脳情報解析研究所 計算脳イメージング研究室
Ryosuke Hayashi(mailto:rhay...@atr.jp)
TEL:0774-95-1217(直通) 内線:1217