USPEX and VASP ( OUTPUT.TXT )

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Najwa Harrati

unread,
Jan 2, 2022, 12:53:25 PM1/2/22
to USPEX
Dear USPEX Developers,

I was running EX01, but the program halted after one generation, and I got the output file "Individual" like below.
 Please kindly let me know what is going on and how to fix this problem.
 Thanks a lot.
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|                          version 10.5.0 (08/07/2021)                         |
|                                                                              |
|             Evolutionary Algorithm Code for Structure Prediction             |
|                      more info at http://uspex-team.org/                     |
|                 report the bugs to : bugr...@uspex-team.org                |
|                                                                              |
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|                  Please cite the following suggested papers                  |
|               when you publish the results obtained from USPEX:              |
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|  Oganov A.R., Glass C.W. (2006). Crystal structure prediction                |
|  using ab initio evolutionary techniques: Principles and applications.       |
|  J. Chem. Phys. 124, 244704                                                  |
|                                                                              |
|  Oganov A.R., Stokes H., Valle M. (2011)                                     |
|  How evolutionary crystal structure prediction works - and why.              |
|  Acc. Chem. Res. 44, 227-237                                                 |
|                                                                              |
|  Lyakhov A.O., Oganov A.R., Stokes H., Zhu Q. (2013)                         |
|  New developments in evolutionary structure prediction algorithm USPEX.      |
|  Comp. Phys. Comm., 184, 1172-1182                                           |
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-------------------- Random topological structure generator --------------------
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|  Bushlanov P.V., Blatov V.A., Oganov A.R. (2019).                            |
|  Topology-based crystal structure generator.                                 |
|  Comp. Phys. Comm., DOI: 10.1016/j.cpc.2018.09.016.                          |
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            Job Starts at                 02-Jan-2022 18:39:46
------------------------- Block for system description -------------------------
                        Dimensionality  :   3
                        Molecular       :   0 (1:Yes, 0,No)
                   Variable Composition :   0 (1:Yes, 0,No)
------------------------- Block for atomic description -------------------------
    There are 1 types of atoms in the system:    Si
    Minimum distances:                    Si: 1.08  

           Good Bonds:                    Si: 0.30  

            valences                        : 4.00  
    The investigated system is: Si_ 8  
----------------------- Block for evolutionary algorithm -----------------------
                 Number of Generations  :      25
               Initial Population Size  :      30
               General Population Size  :      20
---------------------------- AB INITIO CALCULATIONS ----------------------------
*  External Pressure is : 0.0000  GPa*
     Estimated Volume : 118.800  A^3

*  There are  6 local relaxation steps for each individual structure  *
Step  Abinitio Code                  Execute Command            K-resolution
  1      VASP                      mpirun vasp_std > log         0.130
  2      VASP                      mpirun vasp_std > log         0.110
  3      VASP                      mpirun vasp_std > log         0.090
  4      VASP                      mpirun vasp_std > log         0.070
  5      VASP                      mpirun vasp_std > log         0.050
  6      VASP                      mpirun vasp_std > log         0.040

The calculations are performed in nonParallel mode on the local machine
  30 parallel calculations are performed simutaneously

  ID   Origin     Composition  Enthalpy(eV)  Volume(A^3)  KPOINTS  SYMMETRY
""""""""""""""""""
 Sincerely
 HARRATI Najwa
OUTPUT.txt

Phani Ravi Teja Nunna

unread,
Jan 30, 2022, 10:52:10 AM1/30/22
to USPEX
Hello USPEX Developers,

Even I too have the exact same error. I'm running USPEX 10.5.2 and VASP 6.2.1 on my personal laptop running Manjaro Qonos 21.2.2 with Linux kernel 5.15.6-1. I have compiled VASP using the Intel OneAPI package. I'm using a conda environment for Python 3.9.9. Please provide us with some help to overcome this error.

Regards,
Phani

OUTPUT.txt

Ghatoth Gacha

unread,
Mar 4, 2024, 10:11:45 AM3/4/24
to USPEX
any one of you solved it?

On Sunday, January 2, 2022 at 11:53:25 AM UTC-6 harrati...@gmail.com wrote:
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