有關Solexa的使用流程與費用問題

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SH Yen

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Jul 14, 2008, 11:47:02 PM7/14/08
to taiwan_biodiversity_forum
(此封信是將蔣老師的原信與陳老師的回應貼上來, 請各位加入討論的成員繼續回應)

蔣老師,您好

非常謝謝你能提供這麼好的服務機會。我非常有興趣想做珊瑚的部份。但是,我對整個流程、分析與費用不是非常清楚。是否能請你開ㄧ個說明研習會,特別是針
對非模式生物,演化與族群方面的問題應用,ㄧ旦有更多人了解細節(特別是生物資訊分析),就會有更多人能加入,這樣就會有更多的殺價空間。

希望這樣的要求不會過分。

阿倫敬上

日期: Fri, 11 Jul 2008 11:05:52 +0800
寄件者: "Chiang" <tych...@mail.ncku.edu.tw>

Dear All:
成大的Solexa 將於近日內安裝; 想從事nonmodel species 基因體研究的朋友, 建議您先使用454建構一個
transcriptome 的database, 再使用Solexa 針對種間或族群間進行多型性的研究, 我最近與一家私人公司達成一個協議,
如果利用成大Solexa 的研究者, 透過我們送件給454的, 有相當好的優惠(低於陽明的價格; 必須聲明的是我們中心不收454的仲介費用,
完全回饋給大家), 一旦我們的件數多了, 就更有空間再殺價, 目前我們已經接獲的案子有茶葉, 野生雞, 野生阿拉伯芥, 碎米薺(十字花科),
芒草, 陸續會進來的案子有黑熊, 台灣杉, 蝴蝶蘭, 石斑魚等

有意使用的同仁請跟我連絡, 感謝!

鎮宇敬上

SH Yen

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Jul 15, 2008, 1:41:18 AM7/15/08
to taiwan_biodiversity_forum
[以下轉貼蔣老師的回應]

等機器進來 我們會辦一個workshop 告訴大家如何製備cDNA (濃度等條件) 一般我們做非模式物種的基因體 一定先要用454 做一個
transcriptome 的database 以作為後續的基礎我們目前談的價錢大概在76萬台幣左右 454一般比較長 沒有alignment
的問題後續的Solexa的問題多多 有許多分析上的問題 要去克服

鎮宇敬上

On 7月15日, 上午11時47分, SH Yen <shenhorn...@hotmail.com> wrote:
> (此封信是將蔣老師的原信與陳老師的回應貼上來, 請各位加入討論的成員繼續回應)
>
> 蔣老師,您好
>
> 非常謝謝你能提供這麼好的服務機會。我非常有興趣想做珊瑚的部份。但是,我對整個流程、分析與費用不是非常清楚。是否能請你開ㄧ個說明研習會,特別是針
> 對非模式生物,演化與族群方面的問題應用,ㄧ旦有更多人了解細節(特別是生物資訊分析),就會有更多人能加入,這樣就會有更多的殺價空間。
>
> 希望這樣的要求不會過分。
>
> 阿倫敬上
>
> 日期: Fri, 11 Jul 2008 11:05:52 +0800
> 寄件者: "Chiang" <tychi...@mail.ncku.edu.tw>
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