Olá para todos!
Numa entrevista recente para o Blog ACGT (
http://goo.gl/baqimK), Todd harris (o cara responsável por manter o website WormBase atualizado e funcionando), comenta que seus softwares favoritos são BioPerl (por fazer tudo o que você precisa e mais, apesar que eu prefira Python) e GMOD.
O GMOD (acrônimo para o projeto "Generic Model Organism Database") é constituído de diversas ferramentas para manipular, visualizar, armazenar e disseminar informações genéticas e genômicas.
O GMOD inclui ferramentas para "Community Annotation", "Comparative Genome Visualization", "Database Schema", "Database Tools", "Gene Expression Visualization", "Genome Annotation", "Genome Visualization & Editing", "Literatura and Curation Tools", "Moleculat Pathway Visualization", "Orthology Visualization", "Workflow Management", "Middleare", "Tool Integration", "Sequence Alignment" e "Website front end for Chado DB". Uau!
Vocês encontram a lista completa de ferramentas neste URL:
http://gmod.org/wiki/GMOD_Components. Mais informações sobre GMOD podem ser encontradas na wiki do projeto:
http://gmod.org/wiki/Main_Page.
Abraços,
Denis