Compilei uma série de escripts feitos em casa para manipular sequências brutas no formato fasta e fastq. Eu uso estes scripts para mim mesmo mas, como muita gente me pediu uma cópia, estou postando aqui.
Description: The PAckage of TOols with Fast(A/Q) Utilities (PATO-FU) is a collection of homemade Python scripts take can be useful for dealing with raw sequencing data in FASTA or FASTQ format. The programs can also accept gunzip'ed les as input.
Availability: Laboratório de Anfíbios and
Gitlab