Hola Eduardo,
Si te refieres al gráfico que envías, si, efectivamente, actualmente solo se puede generar de uno en uno a nivel de pixel.
Si son muchas parcelas, o lo que necesitas es crear una media (o algún otro estadístico) del valor por parcela, lo que podrías hacer es descargar la serie de tiempo a SEPAL y allí podrías crear un script para extraer los datos de cada una de las parcelas. Alternativamente podrías crear la serie de tiempo directamente en GEE y allí mismo hacer un ReduceRegions por cada una de las parcelas.
Dime qué paso te conviente más y podría ayudarte en el proceso si lo ves necesario.
Daniel G.