O sensor indutivo é o fim de curso apenas do eixo Z.
Pelo que você falou o problema é o posicionamento dos eixos X e/ou Y.
Você ajusta a diferença entre o fim de curso do X e/ou Y e a posição inicial da sua área de impressão ajustando os OFFSETS.
Dá uma olhada no arquivo configuration.h, lá tem o OFFSET dos 3 eixos.
No exemplo abaixo (da minha impressora), quando o fim de curso do X dispara o bico está 28mm fora da mesa, então com este offset a impressora move o X 28mm, a partir do fim de curso do X, que é o início da minha área de impressão.
O mesmo vale para o Y.
No caso do Z, o valor sempre é negativo, e você usa ele para ajustar a diferença em que o sensor indutivo disparou e a posição do bico, no meu caso preciso baixar 0.6mm o bico após o sensor disparar, para que o bico fique bem próximo da mesa.
#define X_PROBE_OFFSET_FROM_EXTRUDER 28 // X offset: -left +right [of the nozzle]
#define Y_PROBE_OFFSET_FROM_EXTRUDER 12 // Y offset: -front +behind [the nozzle]
#define Z_PROBE_OFFSET_FROM_EXTRUDER -.6 // Z offset: -below +above [the nozzle]