Igor vou tentar explicar um pouco como funciona.
Bem só ter um SSL não quer dizer que o site é seguro, pois qualquer um pode usar SSL.
O que manda numa chave SSL é a unidade certificadora, neste caso é um orgão autorizado a emitir certificados onde os browsers reconhecem a unidade certificadora, então todos os certificados emitidos por este orgão serão validos.
O seu certificado está dando erro porque não foi emitido por um orgão certificado por isso ele é um certificado não confiavel.
Se você mesmo gerar um SSL e colocar em seu dominio nao vai funcionar, no caso precisa comprar uma chave em um destes orgãos e dai adicionar em seu site.
Existem Varios tipos de Chave SSL.
no site da comodo (
http://ssl.comodo.com) eles tem os exeplos.
eles ainda oferecem uma versão free para testes.
http://ssl.comodo.com/free-ssl-certificate.php