Erro ao rodar modelo em GLMM

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Bruna

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Sep 15, 2015, 3:04:34 PM9/15/15
to R-Ecology
Boa tarde a todos,

Estou trabalhando em GLMM com distribuição de poisson. Ao rodar o modelo, dá a seguinte mensagem de erro:

#modelo para vi2
> vi2modelo1<-glmer(cbind(vi)~sp+sexo+(1|dia)+(1|id),poisson(link="log"),data=abf)   ### este deu certo

> vi2modelo2<-glmer(cbind(vi)~sp*sexo+(1|dia)+(1|id),poisson(link="log"),data=abf) 
Error in pwrssUpdate(pp, resp, tol = tolPwrss, GQmat = GQmat, compDev = compDev,  : 
  Downdated VtV is not positive definite

> vi2modelo3<-glmer(cbind(vi)~sp+sexo*(1|dia)+(1|id),poisson(link="log"),data=abf) ### deu certo

Uma das características de meus dados é que tenho muitos zeros nas variáveis respostas. Isso pode ser a causa do problema? Mas porque dá certo para alguns argumentos e outros não?

Estou usando o pacote lme4.

Não sei se fui clara na explicação, mas se precisarem de mais informações a respeito é só me dizer. Espero conseguir ajuda para resolver este problema, pois preciso dar continuidade às análises o quanto antes.

Obrigada.


Augusto Ribas

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Sep 15, 2015, 4:00:29 PM9/15/15
to r-eco...@googlegroups.com
Ola, tem uma discussão sobre isso no github onde o pacote lme4 é desenvolvido.

https://github.com/lme4/lme4/issues/173

Talvez você possa sugerir os valores iniciais para os parametros, para facilitar para o otimizador, pelo menos o que entendi é que o algoritimo que otimizador encalha.

Tente produzir um exemplo reproduzivel, sem ter ideia de como são as variaveis é complicado sugerir codigo.

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Grato
Augusto C. A. Ribas
 

Nicholas Marino

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Sep 15, 2015, 6:18:11 PM9/15/15
to r-eco...@googlegroups.com
Oi Bruna!

Os seus dados estao balanceados para todas as combinações de tratamentos?

Enviada do meu iPhone

Bruna Ramos

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Sep 16, 2015, 7:43:58 AM9/16/15
to r-eco...@googlegroups.com
Oi Nicholas,

Desculpa, eu to começando a estudar GLMM e R recentemente, então você poderia me explicar o que você quer dizer com balanceados?

Obrigada

Abs, Bruna

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Bruna Menezes Ramos
Doutoranda em Ecologia - UFRJ
Lab. de Interação Inseto-Planta
Av. Carlos Chagas Filho, 373- Cidade Universitária (Ilha do Fundão), RJ, Brasil 
Telefone: 3938. 6311

Bruna Ramos

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Sep 16, 2015, 8:58:30 AM9/16/15
to r-eco...@googlegroups.com
Oi Nicholas,

sim, meus dados são balanceados (sem dados faltantes).

Obrigada.

Abs, Bruna
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