清扬内网管理软件与WSUS分别安装在两机器上可否？

[Thinklot]

可以的。
分别安装后，在清扬内网管理的[配置]/[统一远程桌面策略配置]中的“设置补丁分发策略”中，导入WSUS注册表模板，填入WSUS服务器的IP地址
就可以啦。