土地利用細部メッシュはラスタではなくポリゴンデータのようですね
ご記載の”エリア”もポリゴンだとすると、
「ベクタ-空間演算-交差」で求められます。
(1)土地利用メッシュを必要部分だけクリップして座標系を平面直角座標にして保存
(2)割合を計算したいエリアのポリゴンを平面直角座標にて作成
下図での赤=計算したいエリアのポリゴンです。
複数ある場合はID等で番号を振り分けてください。
(3)「ベクタ-空間演算-交差」
入力レイヤ=土地利用メッシュ
オーバーレイヤ=エリアポリゴン
入力レイヤからコピーする属性=土地利用種
オーバーレイヤコピーする属性=ID
実行すると下図のようになると思います。
(4)「フィールド計算機」で$areaで面積計算をする。
(5)属性テーブル全体を選択してエクセルにコピペ
SUMIFS関数にて面積の割合を算出
見当違いのアドバイスでしたらすみません