sakuya_izayoi 様
おはようございます。
GDALですがQGISの主要な機能を担っているので、既にインストールされています。
インストール時に次のようなアイコンがあったと思います。

これをダブルクリックするとDosプロンプトみたいな黒い画面が呼び出され、GDALを直接コマンド入力で使うことができます。

ただ、QGIS内でもGDALを少しいじって処理をアレンジすることができます。
英語の情報で申し訳ありませんが、クリッパーを使って切り出すと元の画像サイズより大きくなるなるので圧縮したいというものがありました。
Creating compressed GeoTIFF with QGIS Clipper tool?
https://gis.stackexchange.com/questions/144962/creating-compressed-geotiff-with-qgis-clipper-tool解凍の中にクリッパーのダイアログが出ていますが、赤枠で書き込まれている部分を書き込んでカスタマイズしています(鉛筆ボタンを押すと編集ができます)。
GDALは、この例のように使う方が便利かと思います。
ちなみに「結合」ではオプションで設定出るのですが、一番下のボックスに注目すると面白いです。
オプション設定前

オプション設定後
