こんにちは
これだけの情報ですと、適切にジオリファレンスされているか等も不明瞭ではありますが、
QGIS の右下に記載されているプロジェクト CRS はなんでしょうか
各 GIS データ(ベクタデータもジオリファレンスしたラスタデータも)のそれぞれで利用されている
座標系は、一旦すべて地球上のどの位置に位置するか解釈されたあと、プロジェクト CRS や、
プリントレイアウトで指定した CRS のもと、様々な地図に描画されます
地図は北が上であることが当たり前のように思われますが、表示に使用する CRS によっては
経線が曲がっており、北が必ずしも上を向かず、傾くことはありえます。
背景地図も傾いているように見えることから、そのためではないかと思われます。
(適切な CRS ではないかは、目的によります)
例:モルワイデ図法
例:平面直角座標系2系(一部を除く九州地方)