こちらizayoiです。
どうにもOS依存な部分もあるような気もしますね。私の方でもうまくいくマシンとうまくいかないマシンがあります。
また、qgzファイルをいったん、zipと拡張子を変更した後に、zipファイルを解凍して、解凍先にあるqgsファイルを開いたときにプロジェクトが開けるかですね。
私の場合ですが、3.0から3.4までのすべてで、qgzファイルでのエラー経験があります。今はとりあえず、この方式で保存しないようにしているのが対処方法という感じです。
本当にマシンによってなので、なんとも言えない状況です。