Interpolação usando o método de Krigagem

[Pedro CJunior]

Pessoal,

Estou precisando fazer a interpolação de dados de contaminação de
Nitrato referente à poços de água subterrânea. Me falaram que o método
geoestatístico mais adequado é o de Krigagem.

No QGIS os métodos de interpolação disponíveis são os de Triangulação
e o Inverso do Quadrado. Considerando que a distribuição dos poços em
questão apresenta uma malha irregular, o método de interpolação mais
apropriado para elaboração de mapas de isoteores é a krigagem.

Algum de vocês já fez algo parecido ou tem algum tipo de tutorial que
possa me ajudar?

Grato

[QGIS Brasil Comunidade brasileira]

Oi Pedro,

Olhe em http://www.faunalia.com/plugins

Arthur

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[Andrè Bossan]

Caros,

Tentei copiar camadas dentro do Qgis, mas n�o encontrei esse recurso.
Parece que ele n�o existe mesmo! Ou estou fazendo algo errado?

Eu gostaria de poupar o trabalho de importar o mesmo shape v�rias vezes
para montar mapas diferentes. Algu�m pode me dar uma dica?

Andr� Bossan.

[Andrè Bossan]

Caros,

Fu�ando um pouco acabei descobrindo o "salvar como". Era �bvio,
desculpem pelo inc�modo.

Andr� Bossan.

[yjmenezes]

Pedro,

Bom dia.

Voce tem de habilitar os complementos /experimentais/.
Instalar o SDA4PP.

por favor, posta os resultados e estabilidade, ja que eh experimental

Se nao estiver estavel, tenta o SAGA-GIS, depois volta os resultados para o QGIS. ( tem um plugin tambem )

[]s
julio

[Andrè Bossan]

Caros,

Também tenho interesse em kriging, mas não encontro o SDA4PP (nada mesmo, nem aparece no repositório) e o SAGA não pode ser instalado, pois acusa erro.

Aconteceu com mais alguém?

Andrè Bossan.

--

[Pedro Celestino Dantas]

Caro Júlio,

Valeu pela dica, mas o plugin SDA4PP eu já tinha instalado, bem como os complementos que o plugin necessita, mas a ferramenta Kriging aparece desabilitada.

Observei que no Menu Complementos > Gerenciar Complementos o plugin aparece instalado mas não consigo vê-lo.
Muito entranho não é?

Quanto a sugestão de "QGIS Brasil Comunidade brasileira" (seria legal que se identificasse), eu tenho instalado o SAGA, vi que este SIG tem várias ferramentas de Krigagem, mas confesso que não sei nem por onde começar. Procurei tutoriais na Net mas não encontrei.

Vou tentar encontrar uma outra forma.

Grato

--
Pedro Junior
Geógrafo - CREA/RN: 2107854874
Mestre em Engenharia Sanitária e Ambiental
Analista de Regulação em Saneamento Básico - ARSBAN
Telefones de Contato
(84) 3232-3395 Trab. - 8817-2927(Oi) e 9671-1277(Tim) Cel.

Respeite o ciclista.

Uma bike a mais, um carro a menos.
..... __@
...._ \ >_
...(_)/ (_)____________________________________
░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░\__

[Pedro Celestino Dantas]

Selecione a camada que vc deseja, click na ferramenta de edição, com a ferramenta Selecionar feições, selecione o que quer copiar . Vc vai perceber que a ferramenta copiar, excluir, cortar vão estar ativas (veja figura abaixo). Copie. crie uma nova camada (ponto, linha ou polígono), click em edite e cole.

[Pedro Celestino Dantas]

[Andrè Bossan]

Muito obrigado Pedro!

Eu acabei resolvendo meu problema de outra forma, mas estou adotando a sua sugestão também.
Quando falei em copiar camadas, eu quis dizer copiar tudo mesmo. No meu caso, estou estudando a geologia das folhas sf e sg 23 da carta geológica do Brasil ao milionésimo. Este é um material de vasta riqueza de informação!

Para poder visualizar todas as informações e compará-las, achei mais interessante ter várias camadas "litologia" exibindo dados diferentes sobre esse tema. Por isso eu copiei a camada inteira e colei como uma camada nova, utilizando "salvar como".

Na janela "Salvar Como" dou um nome para a camada nova e seleciono "Adicionar arquivo salvo ao mapa".



Repito a operação para a folha sf23 e finalmente... voila!

Aí estão as duas camadas copiadas.

Só fico na dúvida é se o Qgis criou alguma cópia nova "fora" do meu arquivo "Cartografia geológica".

[edermileno.ggf.br]

O procedimento que você adotou não tem a mesma finalidade do copiar do Arcgis. Na verdade você esta viabilizando outro arquivo, apoiar de ter a mesmas informações. Salvar como é uma copa fee arquivo, e não uma cópia de visualização dentro da vista.
Pelo que sei no qgis, você terá que adicionar novamente o mesmo shp.

Saudações Geográficas

[Cássio Marcelo Castro]

Pessoal

Lembrei aqui deste link, que apresenta, em ingles, algumas dicas legais:

http://www.gistutor.com/quantum-gis.html 

entre elas, interpolar com IDW, 

nao teste, mas espero que ajude

--
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Cássio Castro
Urbanista

Salvador, BA BRASIL

[Andrè Bossan]

É verdade,

Aliás, acabei de verificar que os shapes gerados estão (sobrando) na pasta de instalação do Qgis.

Vou tentar o método sugerido pelo Pedro.

Andrè.

[Andrè Bossan]

Caros,

Meu Qgis (Lisboa em Wxp) não mostra esses complementos SDA4PP. Para piorar, o SAGA não é instalado, pois tem erro, segundo o instalador.

Que fazer?

Andrè.

[Andrè Bossan]

Caros,

Já tivemos uma discussão sobre isso antes, mas o problema continua.
Existe alguma razão para que a ferramenta "recorte" não realizar o
recorte dos polígonos e dos dados ligados a eles? Acredito ter realizado
a operação corretamente, embora me pareça um pouco confusa.

Andrè.

[QGIS Brasil Comunidade brasileira]

Usa Linux. Brincadeira! Mas se quiser brincar será feliz.
Galera que usa Rwindows....ajudem o parceiro.

Arthur

Comunidade QGISBrasil
www.qgisbrasil.org
comun...@qgisbrasil.org

[Andrè Bossan]

Brincadeira nada! Isso é seríssimo.
Volta e meia tento trabalhar com o Linux, mas eu não sou tão bom assim... Infelizmente ainda é preciso ser muito especializado para lidar com as especificidades desse sistema.

Mas ainda chego lá...

Andrè.

[Sidney - Geosaber]

Pedro,

Você é Geólogo ou Eng. Químico? é que tem sido muito comum em empresas (de Saneamento) Ambientais que fazem monitoramento ou remediação de áreas contaminadas (águas subterrâneas e solo) propagarem a idéia de que "o método de interpolação mais apropriado  para elaboração de mapas de isoteores é a krigagem" - para dados de contaminação referente à poços de água subterrânea...

Isso porque na maioria dos casos se usa o programa Surfer {pirata} para fazer a Krigagem com as configurações "default dele", quando muito se ouve um: coloca 1 ali e 10 acolá que dá certo, é experiencia! - ainda não inventaram um botão mágico (como querem nos fazer crer os vendedores de software) para fazer tudo de forma automática (até porque muitos profissionais ficariam sem emprego e quando computadores pensarem sozinhos estaremos perdidos porque será o surgimento da Skynet...) - pior que isso são as agências públicas fiscalizadoras aceitarem esses relatórios... ou por falta de conhecimento (recebem dinheiro público? então vão aprender, oras!) ou por simples má fé...

Isso tudo para dar um nome chique (com pompa de "doutor") a uma interpolação por Regressão Linear (sem análise exploratória, variograma experimental e ajuste do modelo teórico do variograma não se faz Krigagem).

Sobre interpolação:

A Krigagem é um método de estimativa muito usado em mineração porque permite encontrar anisotropias {anomalias que podem indicar um possível depósito mineral) e ainda fazer a quantificação dos erros envolvidos na interpolação das amostras. Em petróleo, por exemplo, a Simulação é mais usada.

O processo da Krigagem envolve em primeiramente se conhecer a distribuição espacial das suas amostras e executar as estatísticas básicas sobre elas - Análise Exploratória, depois se faz o calculo do (Semi)Variograma experimental, para as quatro direções (ou omnidirecional) para identificar as estruturas e anisotropias, em seguida o ajuste do Modelo Teórico do Semivariograma para ter a equação a ser usada pelo método e por fim se faz a Krigagem (que ainda envolve conceitos com Efeito-Pepita, Patamar, Campo Estruturado e Aleatório, e muita continha...)

Outro problema encontrado aqui é a quantidade de amostras que você estará usando (poços de águas subterrâneas não costumam ultrapassar um dezena), pois isso pode aparentemente não conseguir mostrar as estruturas de seu Semivariograma, e por consequência não poderá fazer a Krigagem.

Leia mais nos trabalhos dos professores Paulo Landim (livros Análise Estatística de Dados Geológicos e Análise Estatística de Dados Geológicos Multivariados, bem como os textos escritos por ele, inclusive sobre a geração de mapas por interpolação usando o programa Surfer) e Jorge Yamamoto (Avaliação e classificação de reservas minerais e outros artigos escritos por ele e pelo professor Marcelo Rocha).

Sobre os complementos do QGIS:

1. Plugin de Interpolação: no caso de dados amostrais (teores / concentrações) o método mais indicado é o IDW (Inverso ao Quadrado da Distância), que pode apresentar um inconveniente nos resultados que são os chamados "olhos-de-boi" {bulleyes} se existirem concentrações de amostras localmente. O outro, TIN (Rede de Triangulação Irregular, que vem do método Triangulação de Delaunay) é mais indicado para Modelos Digitais de Terreno {tem uma apostila do Landim onde ele faz as considerações sobre os métodos de interpolação e seu uso).
2. SDA4PP (Spatial Data Analysis For Point Pattern): poderosa ferramenta que usa o programa R Statistical Computing para realizar análises Geoestatísticas. Um porém advém do fato dele usar um algoritmo automática para fazer o ajuste do Variograma (o que como sabemos, aqui é onde o conhecimento e experiência do Geólogo faz toda a diferença...).

• Para que ele funcione é imperativo a instalação e correta configuração do programa R (bem como dos pacotes: maptools_0.7-26, rgdal_0.6-28, spatstat_1.20-3 e outros que são opcionais);
• Na instalação do QGIS 1.7.0 é preciso instalar junto o Python 2.6.5 (com os módulos: NumPy 1.3.0, PyWin32 212 (required for Windows OS) e RPy2 2.0.8 - esse nem deus conseguiu fazer que funcionasse no meu Win7, não sei como é no Linux...);
• Instale o complemento SDA4PP, no menu dele vai aparecer a opção: {Components/R Packages} que fará um diagnóstico e irá te dizer se o R-cran e os módulos Pywin32 e Rpy2 estão funcionando. ( caso positivo, é só fazer a Krigagem).
• http://opensourcegisdevelopment.wordpress.com/2012/05/14/sda4pp-spatial-data-analysis-for-point-pattern
  

1. SAGA GIS: um dos mais completos programas de análises, pode ser usado diretamente dentro do QGIS através dos complementos Processing Framework / SAGA ou pelo Ambiente de Análise Espacial SEXTANTE. No primeiro caso é preciso instalar o SAGA Python Bindings, e depois os complementos PF e por ultimo o SAGA.

• Para usar o SAGA dentro do SEXTANTE, primeiro instale e configure o SAGA GIS. Depois instale o QGIS, e o complemento SEXTANTE, configure ele apontando o caminho para o local da instalação do SAGA GIS (pode ser o 64bits). Pronto, agora podes desfrutar dos módulos do SAGA dentro do QGIS de forma estável, graças ao Ambiente SEXTANTE.

Referências:

• http://opensourcegisdevelopment.wordpress.com/2012/05/14/sda4pp-spatial-data-analysis-for-point-pattern
  
• http://spatial-analyst.net/wiki/index.php?title=Software
  
• http://www.environment.uwaterloo.ca/u/brenning/Brenning-2008-RSAGA.pdf
  
• http://geostat-course.org/system/files/ov_GA_DAY3_Hengl.pdf
  
• http://geostat-course.org
  
• http://www.spatialanalysisonline.com
  

Agradecimentos aos professores da Geologia Marcelo Rocha (USP), Jorge Kazuo Yamamoto (USP) e Paulo Milton Barbosa Landim (UNESP) pelas aulas de Geoestatística.

Sidney Goveia

http://www.geosaber.com.br

[Andrè Bossan]

Sidney,

Realmente, foi isso o que aprendi no curso que fiz no SENAC. O professor Jung, que deve ser conhecido entre vocês, ministrou as aulas de geoestatística. Aliás, devo dizer que as exatas NÃO são o meu forte, então quando digo que "aprendi" é numa acepção bem flexível...

Diante dessa e de outras dúvidas que tenho, gostaria de propor aqui a formação de um grupo para discutir melhor a geoestatística. Talvez escolhendo uma obra e escrevendo sobre ela, capítulo a capítulo.

Fica a sugestão para os colegas.

Andrè.

[QGIS Brasil Comunidade brasileira]

Blz Sidney.
Estava para dizer isso, mas sabia que seria longo como foi para você. Esse blá todo de geoestatística é realmente necessário para desmistificar a crença de que a Krigagem é o método absoluto. Fiz geoestatística na graduação e no mestrado e até hoje tenho dúvidas de como acertar os parâmetros para rodar a krigagem. Lembro de ter usado o GSLIB que é opensource e está (se não me engano) embutido no código fonte do Spring. No doutorado utilizei da interpolação no Spring para dados de águas subterrâneas.

Esse teu trabalho bem que poderia virar um tuto no blog da comuna ou parte do manual.

Abs
Arthur

[Andrè Bossan]

Caros,

Consegui fazer o recorte no Sextante, porém, via gvSIG. Minha instalação
do sextante no Qgis simplesmente sumiu, embora o gerenciador acuse a sua
presença...

Será que tudo isso é culpa do Windows?

Andrè.

[Sidney - Geosaber]

Parece que tá misturado as postagens, ou eu tô ficando lôco?

Arthur,

Quando vi a pergunta eu me cocei para responder na lata (mesmo no meio do feriado, apesar de eu estar estudando), mas logo vi que devido a  complexidade do assunto uma resposta curta não servia.

Acredita que um vendedor de software (líder de mercado) falou para mim e o pior para o Prof. Marcelo Rocha (especialista em Geoestatística) que com o novo módulo de Análise de Geoestatística qualquer um poderia ter resultados apertando 3  botões, isso no meio do pátio da Geologia - USP durante uma apresentação de softwares de mineração!

Com esses botões mágicos as empresas de mineração não precisam pagar pelos mais caros geólogos (especialistas em geoestatistica) e por estagiários para fazer as modelagens...

Eu tenho pensado em fazer uma publicação sobre isso, a primeira postagem do meu blog (nov/2007) tinha essa intenção, mas se tornou mais uma tarefa que deixo parada por falta de tempo (e falta de esforço, eu confesso). Já conversei com o Prof. Marcelo a respeito inclusive de escrever um artigo, SIG e Geoestatística, mas ficou no projeto.

André, eu conheci o Jun (Eduardo Jun Shinohara - é ele?) quando entrei na geologia na USP, e matemática me parece que sempre foi um tabu entre os Geólogos (talvez por isso os que sabem matemática sejam os mais bem pagos!).

Como disseram Michael Goodchild (geógrafo americano) e Graeme Bonham-Carter (geólogo inglês) a muito mais que uma década {minhas referências em SIG}, que os SIG são muito mais que programas de computador. Por isso que aprender a usar um SIG vai muito além de saber mexer nas ferramentas, mas principalmente saber o que se está fazendo, só assim se pode saber os resultados a serem esperados.

Tenho um amigo que o IC dele foi transcrever o código do GSLib de Fortran para Delphi (bem, o TCC dele foi com Simulação Estocástica! e o mestrado, algo parecido, procure por Watanabe, J.).

O Idrisi (o melhor programa de análise espacial comercial que existe) incorporou os algoritmos do GStat, outro programa Open Source, esse casamento de programas de Geoestatística com SIG tem várias vertentes.

Eu nunca estudei melhor o SAGA e as ferramentas de Geoestatísitca, nem o GRASS, mas fiquei bem empolgado quando conheci o complemento do QGIS o SDA4PP, que gostaria muito de explorar, mas nunca consegui fazer com que rodasse no Windows 7 {pode me dizer que é mais um bom motivo para mudar para o Linux, eu comecei no SIG usando o ArcInfo em UNIX}.

Vou transformar a resposta dessa postagem em um artigo no site do QGISBrasil, acho que você está certo e vale a pena descrever as funcionalidades dos complementos Interpolador, Home Range e SDA4PP (vou pedir ajuda para aquela moça que deu dicas sobre o HR aqui mesmo no Grupo, pois me ajudou a fazê-lo rodar parcialmente).

Boa noite a todos, conversaremos mais em outra oportunidade.

Sidney Goveia

http://www.geosaber.com.br

[Pedro Celestino Dantas]

Caro Sidney,

Sou Geógrafo, Mestre em Eng. Sanitária e Analista de Regulação em Saneamento Básico da Agência Reguladora de Saneamento de Natal -RN (http://www.natal.rn.gov.br/arsban/).

Em Natal, 70% da parte Sul da Cidade é abastecida por poços de água subterrânea. Ao todo a operadora possui mais de 150 poços de captações. Na prática a ARSBAN monitora uma vez por ano todos os poços. Na ocasião é feita a coleta da água, sendo analisado os parâmetros estabelecidos pela Portaria 2914/2011. Dentre eles o parâmetro Nitrato é um dos que tem limitado o consumo de determinados poços, atingindo níveis altíssimos 25-30mg/l (Limite permitido 10mg/l).

Diante dos dados procurei orientação com um prof. da UFRN do Departamento de Geológia, o qual me informou que utiliza o método de Krigagem Linear no SURF (Pirata), para fazer interpolações de Isoteores.

Eu vinha utilizando um dos métodos que o QGIS dispõe (Peso pelo Inverso da Distância - IDW), sendo a Distância para coeficiente P (2,00). Observo que o produto representa algo parecido com a realidade, apesar de não saber bem o que quer dizer o valor 2 (default) e os números de linhas e colunas que aparecem na caixa de diálogo.

Diante das explicações dada pelo Prof. Iniciei várias pesquisa sem sucesso. Por isso o motivo desta postagem é "Interpolação usando o método de Krigagem"

[Sidney - Geosaber]

Pedro,

Desculpe ser curioso, eu fico interessado em conhecer as pessoas e em que elas trabalham, porque isso mostra a abrangência do SIG e para mim, que trabalho com cursos é bom para exemplificar seus usos e aplicações.

Longe de mim questionar qualquer professor, {eu mesmo, se tivesse me dedicado mais, hoje estaria no meio acadêmico, coisa que os professores com quem trabalhei sempre fazem questão de lembrar}, inclusive porque pela quantidade de amostras pode-se usar a Krigagem sim, só é preciso cuidar com a entrada correta dos parâmetros.

Poços de monitoramento de  contaminação não passam de poucas dezenas, mas no seu caso a quantidade deve ser suficiente, precisa fazer o Semivariograma para ter certeza.

Você teria um conjunto de amostras para fazer um teste {no caso dos dados não tiverem restrições, sempre é importante respeitar o sigilo das informações}. Assim eu posso montar um caminho de como fazer pelo QGIS, e com o auxílio dos professores de Geoestatística do laboratório onde eu trabalho (LIG-IGc/USP), se for permitido dá até para sair uma publicação disso.

O método IDW (numa melhor tradução é 'Ponderação pelo Inverso da Distância'), mais conhecido em português como IQD - Inverso do Quadrado da Distância ou Inverso da Distância ao Quadrado. Também pode ser Inverso da Potência da Distância, e esse P = 2 é justamente a Potencia à que se está elevando a Distância Invertida, como o melhor resultado é com a potência 2 (ao Quadrado) temos (1/D)² para calcular o peso de cada amostra.

já o número de linhas e colunas é o tamanho de sua malha (de pixels), divida um pelo outro e você terá o tamanho das células (pixels), assim você determina a resolução do raster que vai ser gerado.

Tenho que ir,mas se quiser podemos ir conversando.

Sidney Goveia

http://www.geosaber.com.br

[Andrè Bossan]

� isso mesmo, Sidney!

Foi com o Jun que aprendi algo de geoestat�stica. Deu vontade de
aprender mais!

Andr�.

Em 10/9/2012 02:27, Sidney - Geosaber escreveu:
> Parece que t� misturado as postagens, ou eu t� ficando l�co?

>
> Arthur,
>
> Quando vi a pergunta eu me cocei para responder na lata (mesmo no meio
> do feriado, apesar de eu estar estudando), mas logo vi que devido a

> complexidade do assunto uma resposta curta n�o servia.
> Acredita que um vendedor de software (l�der de mercado) falou para mim
> e o pior para o Prof. Marcelo Rocha (especialista em Geoestat�stica)
> que com o novo m�dulo de An�lise de Geoestat�stica qualquer um poderia
> ter resultados apertando 3 bot�es, isso no meio do p�tio da Geologia
> - USP durante uma apresenta��o de softwares de minera��o!
> Com esses bot�es m�gicos as empresas de minera��o n�o precisam pagar
> pelos mais caros ge�logos (especialistas em geoestatistica) e por
> estagi�rios para fazer as modelagens...
>
> Eu tenho pensado em fazer uma publica��o sobre isso, a primeira
> postagem do meu blog (nov/2007) tinha essa inten��o, mas se tornou

> mais uma tarefa que deixo parada por falta de tempo (e falta de

> esfor�o, eu confesso). J� conversei com o Prof. Marcelo a respeito
> inclusive de escrever um artigo, SIG e Geoestat�stica, mas ficou no
> projeto.
>
> Andr�, eu conheci o Jun (Eduardo Jun Shinohara - � ele?) quando entrei
> na geologia na USP, e matem�tica me parece que sempre foi um tabu
> entre os Ge�logos (talvez por isso os que sabem matem�tica sejam os
> mais bem pagos!).
> Como disseram Michael Goodchild (ge�grafo americano) e Graeme
> Bonham-Carter (ge�logo ingl�s) a muito mais que uma d�cada {minhas
> refer�ncias em SIG}, que os SIG s�o muito mais que programas de
> computador. Por isso que aprender a usar um SIG vai muito al�m de
> saber mexer nas ferramentas, mas principalmente saber o que se est�
> fazendo, s� assim se pode saber os resultados a serem esperados.
>
> Tenho um amigo que o IC dele foi transcrever o c�digo do GSLib de
> Fortran para Delphi (bem, o TCC dele foi com Simula��o Estoc�stica! e

> o mestrado, algo parecido, procure por Watanabe, J.).

> O Idrisi (o melhor programa de an�lise espacial comercial que existe)

> incorporou os algoritmos do GStat, outro programa Open Source, esse

> casamento de programas de Geoestat�stica com SIG tem v�rias vertentes.
> Eu nunca estudei melhor o SAGA e as ferramentas de Geoestat�sitca, nem

> o GRASS, mas fiquei bem empolgado quando conheci o complemento do QGIS
> o SDA4PP, que gostaria muito de explorar, mas nunca consegui fazer com

> que rodasse no Windows 7 {pode me dizer que � mais um bom motivo para

> mudar para o Linux, eu comecei no SIG usando o ArcInfo em UNIX}.
>
> Vou transformar a resposta dessa postagem em um artigo no site do

> QGISBrasil, acho que voc� est� certo e vale a pena descrever as

> funcionalidades dos complementos Interpolador, Home Range e SDA4PP

> (vou pedir ajuda para aquela mo�a que deu dicas sobre o HR aqui mesmo
> no Grupo, pois me ajudou a faz�-lo rodar parcialmente).

>
> Boa noite a todos, conversaremos mais em outra oportunidade.
>
> Sidney Goveia
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[Sidney - Geosaber]

Tutorial em português sobre o complemento {Interpolador}:  http://opussig.blogspot.com.br/2011/12/interpoladores-i-qgis-interpolation.html

[MCSS]

Boa tarde

Estou a fazer uma interpolação com o IDW (Raster>analise>grelha>interpolação) e tudo corre bem excepto o facto de ficar com pontinhos nas manchas de cor que referenciam a variabilidade dos dados. como posso suavizar esse efeito e ficar sem esses pontinhos? (pontos da shape de pontos onde baseei a interpolação)

Alguém me pode ajudar?

Estou há muito tempo a tentar.

Obrigada

[Pedro Celestino Dantas]

Ver se este post te ajuda

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