Para fazer recortes de vetores usando outros vetores:
Menu VETOR > Ferramentas de geoprocessamento > Recortar...
Para unir, você quer unir arquivos diferentes em um só? ou quer unir um vetor em outro.
Para unir vários arquivos diferentes em um só, pode usar o Copia > Cola.... ou ir em Processar e utilizar a ferramenta Mesclar Camadas.
Agora se vc quer unir uma linha que se liga em outra, vc tem de usar o Dissover ou a ferramenta união em Vetor > Ferramentas de Geoprocessamento.
Vai depender do resultado que quer alcançar.