Rapaz,
O file geodatabase é um formato proprietário do ArcGis e a maior parte de arquivos em formatos proprietários são problemáticos para fazer abrir em outros softwares. Na instalação do QGIS avançada pelo OSGEO4W, disponível no site, existe uma biblioteca que lê "file geodatabases", no entanto é possível que ocorram erros, porque a cada versão do ArcGis também muda-se a versão do *.gdb. Quando você instala essa biblioteca, você abre o *.gdb pelo caminho da imagem abaixo:
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Teste aí e depois nos fale se deu certo. Outra coisa, até onde sei também não há a possibilidade de edição dos dados nesse formato. Para mim existia essa possibilidade no personal geodatabase, mas Anderson Medeiros me disse que também não pode.
Att,
Harlan.