Bom dia, Murilo.
Acredito que seria interessante você realizar o download das cenas no site do Earthexplorer ou Glovis, verificando o nível de registro das cenas.
Pode verificar isso nas suas também.
A Landsat8 ela vem registrada e ortorretificada salvo engano é (L4).
A Landsat5 nem sempre. Se tu já tinhas essa imagem adquirida de longa data, provavelmente o registro é grosseiro (L2).
Sendo grosseiro, você deve registrá-la.
Para isso você pode usar uma imagem com nível 4 de registro como base, e data o mais próximo possível da sua Landsat5.
Eng. Agrº Sérgio Luís Bianchini
Campo Grande - MS