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Aplicação do filtro Multi direction lee do SAGA (Há outros com resultados similares)
Clusterização usando o algorítimo "Cluster analysis for grids" aplicada a imagem filtrada (SAGA)
Vetorização das Zonas (aqui você pode usar o método estatístico que deseja para atribuir o valor aos polígonos de zonas, usei a média do NDVI da imagem original) - Estatística por zonas do QGIS - Perceba que houve uma edição mínima para redução de zonas muito pequenas, talvez estas poderiam ser eliminadas já nos parâmetros da filtragem.
Rasterização das zonas de manejo com os valores médios do NDVI (fiz com NDVI para teste mas poderia ser feito com qualquer atributo rasterizável ou a correlação entre atributos etc...)