Mapas de Kernel

[Geovane Tavares Cavalcante]

Pessoal,

Há como gerar mapas de Kernel (pontos quentes) no QGIS? Qual seria o procedimento?

[]'s

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Geovane Tavares

[Sidney - Geosaber]

Use o complemento SDA4PP - Spatial Data Analisis for Point Pattern - Kernel Density.

[Geovane Tavares Cavalcante]

Tentei, mas não soube usar esse complemento.

Vocês conhecem algum tutorial?

[]'s

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Geovane Tavares

[Sidney - Geosaber]

Você pode usar o OpenGeoDA, programa aberto para Análise Espacial de Dados Pontuais (ou Amostrais), é mais simples que o R e roda em todos os SOs principais.

Baixe:  http://geodacenter.asu.edu/software/downloads e tem material para aprender a usá-lo: http://geodacenter.asu.edu/pdf/geodaGA.pdf

Outro muito simples de usar é o Terraview (INPE) que faz mapa de kernel com dois cliques, e  tem documentação em português.

O SDA4PP (Spatial Data Analysis for Point Pattern with R. REQUIRES QGIS 1.x, Python 2.5.2, Rpy2 and sp, maptools, spatstat and rgdal packages in R-cran) é bem complexo e a documentação é só aquela que vem no help, pois o site do desenvolvedor (http://ggit.metu.edu.tr/~volkan/index.html) está fora do ar. O plugin Home Range é semelhante (inclusive por usar o R também), mas é um pouco mais simples.

Links:

1. http://code.google.com/p/sda4pp/ 
   
2. http://www.csiro.au/files/files/piph.pdf
   
3. http://school.maths.uwa.edu.au/~adrian/
   
• http://www.csiro.au/resources/~/media/CSIROau/Divisions/CSIRO%20Mathematics%20Informatics%20%20Statistics/Rspatialcourse_CMIS_PDF%20Standard.pdf (workshop R)
  
4. http://www.seas.upenn.edu/~ese502/
   
5. http://spatial-analyst.net/book/
   
• baixe gratuitamente o livro:  http://spatial-analyst.net/book/sites/default/files/Hengl_2009_GEOSTATe2c1w.pdf (SAGA + R + GE)

Pra variar meus plugins Python estão quebrados (principalmente o Rpy2) por isso não posso testar os dois complementos (SDA4PP e Home Range) para poder te orientar, assim que eles voltarem a funcionar eu monto uma receita para uso deles.

[Rosana da Silva Peixoto]

Utilizo constantemente o plugin Home Range. É fácil de usar e gera mapas Kernel com várias opções (adjusted R, LSCV,...). Mas é preciso ter no R os seguintes pacotes instalados: rgdal, ade4, adehabitat, gpclib e shapefiles.
Se tiver alguma dificuldade para usar passo-lhe um tutorial.

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MSC Rosana Peixoto
Doutoranda em Biologia, UE - Portugal
Profª Assistente de Zoologia - UNEB
Campus VII - Sr. do Bonfim
 
Celular: 55 71 87479196/99607189
Fixo: 55 71 33640671
e-mail: rosana....@gmail.com/rpei...@uneb.br
 

[Ander]

Rosana,
Eu gostaria de receber o tutorial. Se puder postar no grupo ficaria grato.
Valeu!

 
Anderson Roberto da Silva
Engenheiro Cartógrafo
Analista de Cartografia - Battistella Florestal

[Paulo Henrique Damasceno Machado]

Eu gostaria de receber uma cópia do tutorial, trabalho com ecologia de populações e comunidades e estou procurando por ferramentas capazes de responder à questões relativas a distribuição espacial de organismos, inclusive no aspecto de distribuição geográfica do complexo gênico dos gruposgrupos.

[Sidney - Geosaber]

Rosana,

Você usa Windows? Qual a versão do R, GDAL e Python que você tem instalado?

No meu computador (Win7Pro/x64) eu tenho o QGIS 1.7.4-5, instalado pelo OSGeo4W (com todas as dependências através dele), estava usando o R 2.15 e o Python 2.7 (apesar que o QGIS usa o Python que vem com o OSGeo4W).

O pior é que o SDA4PP reconhece o R e o Rpy2, mas diz que falta o R-CRAN (que é o network server), você fez alguma mudança de configuração para o R para ele funcionar com o QGIS?

Os complementos SPRQ e Home Range também não funcionam, pois ambos também dependem do R. Já os algoritmos do R que vem no SEXTANTE Toolbox estão funcionando!

Seria interessante falar com o Arthur Nanni para colocar o tutorial no site do QGISBrasil, se você quiser é claro.

Abs,

Sidney.

[Rosana da Silva Peixoto]

Voces estão tendo os mesmos problemas de instalação que tive. Utilizo o Windows e a versão 1.8 do QGis, instalei a versão 2.9.1 do R. Conheço um dos idealizadores do QGis e ele passou-me os passos que estão em anexo (no momento não tenho tempo de organizar melhor, mas penso que está claro), eu reinstalei tudo seguindo as indicações e não tive mais problemas.
Ao instalar o R é preciso certificar-se que o programa vai ser reconhecido pelo QGis. Este passo também está em anexo.
Assim que possível organizo melhor e coloco no site do QGisBRasil.
Quanto a utilizar o plugin Home Range é preciso ter as "shape files" organizadas, coloque o mesmo ID para todas as coordenadas. Abra o plugin e em "layer" selecione a sua shape e em "group fixes by" selecione ID, depois é só escolher o tipo de kernel que deseja e o percentual adequado para o seu trabalho. Selecione "add result layer to the project" e o kernel aparecera no ecran.
Espero ter ajudado.
Rosana

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[Leonardo Lepesqueur]

Olá Rosana!
Estava procurando exatamente isto.
Agradeço pela boa vontade de ter providenciado este tutorial
.
Vou tentar aqui.

Obrigado pela colaboração com o grupo.
Leonardo Lepesqueur

e-mail: rosana....@gmail.com/rpeixo...@uneb.br