Grupo de bioinformática

[Laerte M. Rodrigues]

Pessoal,

estou a procura de um grupo de pesquisa em bioinformática, moro em Minas, mas aqui, nao achei nenhum, caso tenha algum grupo ou integrante do mesmo que keira aceitar um membro a distancia, e, dependendo do caso, tenho disponibilidade de viagem para possiveis reuniões/palestras.

Minha formação é Computação, estou terminando o mestrado na área de computação também, mas focando na bioinformática.

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Grato,

Laerte Mateus Rodrigues
Mestrando em informática (PUC Minas)

http://laertemateus.com.br

[Cassio]

Olá Laerte,

Sou moderador do grupo python-mg[1] e sugiro postar lá.Talvez consiga algum membro que esteja com projeto similar ao seu ou alguém que lhe ajude.
Será muito bem vindo na nossa lista e ajudaremos no que for necessário.

Abraços,

Cássio Botaro

[1]https://groups.google.com/forum/?fromgroups#!forum/python-mg

[Laerte M. Rodrigues]

ok!

vou me registrar agora

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Grupo Python-Brasil
http://www.python.org.br/wiki/AntesDePerguntar
 
<*> Para visitar o site do grupo na web, acesse:
http://groups.google.com/group/python-brasil
 
<*> Para sair deste grupo, envie um e-mail para:
python-brasi...@googlegroups.com

[rodrigo koblitz]

Olá,

qual Bio está falando?

molecular, genética, ecologia?

eu estou querendo compartilhar experiencia em Ecologia, se for seu caso e vc conhecer algum grupo, por gentileza me informe,

abs,

Koblitz

[Laerte M. Rodrigues]

gostaria de trabalhar na áera de molecular e/ou genética

qndo ficar sabendo de ecologia eu lhe aviso

[Luciano Ramalho]

Oi, Laerte, Acho que vc tem mais é que se juntar ao grupo python-mg
como o Cassio sugeriu.

Mas para encontrar mais interessados em bioinformática com Python,
acho que não é uma boa idéia se limitar a uma unidade da federação,
mesmo uma grande como Minas!

Eu conheço pelo menos umas três pessoas que trabalham com Python e
bioinformática no Brasil, mas tenho certeza que seu eu procurasse
acharia mais uma duzia em pouco tempo.

Acho que tá na hora de vcs criarem um grupo de discussão temático, se
é que já não existe. Três é pouco mais é um começo, havendo um ponto
de encontro depois as pessoas aparecem, se vcs divulgarem em listas de
Python e listas de bioinfo.

[ ]s
Luciano

2012/4/13 Laerte M. Rodrigues <laerte...@gmail.com>:

--
Luciano Ramalho
Twitter: @luciano
Autor e instrutor da Academia Python na Globalcode
http://python.globalcode.com.br

[Guilherme Loss]

opa

eu trabalho com bioinfo... aqui na UFRGS

mas com mais a parte de biolgia molecular,

sequeciamento, etc...

sou biólogo e algum tempinho me dedico tmb a

python... que acabou virando uma paixão...

atualmente estudo mais sobre programação q biologia...

eheheh

quando descobri tudo q essa linguagem pode fazer...

achei incrivel

bem mas quanto a sua duvida,

o nosso grupo interage com um grpo da info da UFRGS

basicamente para tentar usar apreendizagem de máquina

para tentar resover algumas quesçtoes biológicas..

algumas coisas que noto (ao menos na experiência que passei):

perl ainda é muito forte... na unicamp tem um grupo de bioinfo, que interagimos há algum tempo

algumas rotinas feitas por eles é toda em perl...(nada contra)

"R" está tomando muita força principalmente para analise e visualização 

de dados de sequenciamento

e python esta tomando espaço rapidamente...

em dinâmica molecular como falei em outra threat existe o pymol...

por ser muito simples, clara e de facil apreendizagem...pessoas que não são da área da computação conseguem apreender, o básico ao menos, e se virar em algumas analises... e sem ter que re inventar a roda

usar biopython e conseguir analisar os seus dados...

bem a quanto grupode de bioinfo

 tem vários..

tem um de dinâmica modelcular de proteínas na UFRGS, o professos é amigo meu...

eles na verdade são mais usuários, usam pacote prontos, não programam, até onde eu sei

existe um programa de pós-graduçaõ em bioinfo na UFPR, não conheço nada lá, mas deve ter grupos...

tem na unicamp, como falei...

2012/4/13 Laerte M. Rodrigues <laerte...@gmail.com>

gostaria de trabalhar na áera de molecular e/ou genética

--
Guilherme Loss de Morais M.Sc.
Ph.D. student in Cellular and Molecular Biology
CBiot - UFRGS - Brazil
http://www.ufrgs.br/rnai/LGPP.htm

[Michelle Borges]

Laerte, eu não trabalho.. mas meu amigo é super inteirado e desenvolve algumas pesquisas na area, no laboratorio de Polimorfismo de DNA (Bioinformatica) na UFPA. Ele é engenheiro da Computação. Acho que vcs vão ter muito a compartilhar.

O e-mail dele é nilson....@gmail.com 

Abraços,

Michelle Miranda
Graduanda em Bacharelado em Informática Agrária - UFRA
CIA / DCE-UFRA / ENEC / ANEL

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De: Laerte M. Rodrigues <laerte...@gmail.com>
Para: python...@googlegroups.com
Enviadas: Sexta-feira, 13 de Abril de 2012 15:27
Assunto: Re: [python-brasil] Re: Grupo de bioinformática

[Guilherme Loss]

como o Luciano

sugeriu, 

eu sou parceiro de montar um grupo de discussão pra bioinfo

abraço

2012/4/13 Guilherme Loss <guilher...@gmail.com>

[Luiz Irber]

Dá para usar a lista da PyScience também,

http://groups.google.com/group/pyscience-brasil

Mais infos em http://pyscience-brasil.wikidot.com/

Luiz Irber

2012/4/13 Michelle Borges <biamichel...@yahoo.com.br>:

[Henrique Senna]

Falando de grupos temáticos.

Gostaria de saber se existe algum na área de energia e outro na área de gráficos. Alguém conhece?

[Guilherme Loss]

Laerte

a UFMG

tem pós-graduação em bioinformatica...

tem bastante grupos e linhas de pesquisa...

http://biotec.icb.ufmg.br/bioinformatica/historico/index.php

abraço e boa sorte

2012/4/13 Henrique Senna <rico...@gmail.com>

[Alfredo Guilherme Silva Souza]

Guilherme Boa Noite !

Tem como você postar o link do grupo sobre Dinâmica Molecular de Proteínas ?

[Laerte M. Rodrigues]

ola a todos,

mto obrigado pela cooperação, mas vamos as respostas:

com relação ao grupo, ja tentei pessoalmente na UFMG, mas lah eh mto fechado, e vc tem q ser aluno de la para participar... vou tentar no inicio do prox ano um curso de verão em bioinformática la para ver se me intereajo.

COm relação a distancia, como havia falado no email q abriu a discussão, pode ser em outro estado, contando q contem comigo para algum proj.

Sou da área da computação e comecei a + ou - 1 ano e 1/2 a mecher com bioinf, em função da minha dissertação... mas quero continuar ativo, soh nao sei onde!

Michele, mto obrigado pelo contato, vou falar com este rapaz sim.

o q eu gostaria eh de me envovler em um proj da area para abrir meu campo de visão e estudar + da area de biologia!

como havia dito, caso seja necessário, faço até uma viagem para um encontro pessoal se der certo a cooperação

[Guilherme Loss]

a pedidos

http://www.cbiot.ufrgs.br/bioinfo/index.php?module=abertura