Hola Luis,
Los archivos xml son textos puros, con un formato definido.
No hay forma de proteger, la finalidad de este formato de archivo es
justamente que la información sea accesible desde cualquier programa
que acepte archivos con formato xml.
Lo que podrías es pasar los datos con tablas libres con los datos
encriptados.
Saludos,
Alcides Portillo