Jaime fiz um teste aqui e deu certo, pelo visto vou ter que alterar bem pouco nos programas.
Muito obrigado.
Uma observação.
As filiais que vão usar o LibreOffice acessam o sistema via Citrix, no sitrix está instalado o LibreOffice e na maquina local está instalado o Office da MS.
Tem como configurar uma variável local no servidor ou path para que quando usar o comando "Excel.Application" ele busque na maquina do usuário que seria o "U:\Arquivos de Programa\..."
Só estou procurando uma alternativa pra não ter que alterar todos os programas.