info
Google Groups no longer supports new Usenet posts or subscriptions. Historical content remains viewable.
Dismiss
Dowody na ewolucję adaptacyjną w domenie wiążącej receptor sezonowych koronawirusów
1 view
Skip to first unread message
Slawek
Jul 22, 2021, 8:52:38 PM7/22/21
to
Informacja o pojawieniu się nowych wariantów koronawirusa SARS-CoV-2,z UK i RPA systematycznie przenika do wiadomości publicznej od początku roku niepokojąc ludzi. Od lat wiadomo, że wirusy mutują, więc nowe warianty nie są zaskakujące. Jednak fenotypy związane z tymi zmianami mogą budzić uzasadnione obawy, szczególnie jeśli wpływają na pamięć immunologiczną, lub skuteczność szczepionek!
Obecnie naukowcy koncentrują się nad wpływem dryfu antygenowego (na powolnych zmianach mutacyjnych w czasie) w celu unikania odpowiedzi immunologicznej przez sezonowe koronawirusy. Wykazali, że dwa sezonowe ludzkie koronawirusy przechodzą transformacje adaptacyjna w obszarach białka zwanego kolcem, które to struktury są najbardziej eksponowane, tym samym narażone na odpowiedź uladu odpornosciowego
( za odpowiedź humoralną). Odkrycia sugerują, że może być konieczna ciągła zmiana składu szczepionek na koronawirusa.
Istmnieją setki gatunków koronawirusów infekujacych takie zwierzęta, jak nietoperze, koty, świnie i wielbłądy. Jak dotąd wiadomo, że siedem różnych koronawirusów infekuje ludzi. Koronawirusy, które często infekują ludzi powodując łagodny przebieg zakażen, które prawdopodobnie przypomina zwykłe przeziębienie, to 229E, NL63, OC43 i HKU1. Druga, bardziej znana grupa składa się z MERS-CoV, SARS-CoV i SARS-CoV-2.
Wiadomo, że niektóre koronawirusy ponownie infekują ludzi, ale nie jest jasne w jakim stopniu jest to spowodowane naturalnym zanikiem ludzkiej pamięci immunologicznej, a na ile dryfem antygenów” – powiedziała autorka badań Kathryn Kistler, doktorantka z Vaccine and Infectious Disease Division Fred Hutchinson Cancer Research Centrum w Seattle, dodając: „Chcieliśmy zbadać, czy istnieją dowody na to, że koronawirusy związane z SARS-CoV-2 (mutanty wywodzące się od chińskiego szczepu, który rozpoczął pandemię) ewoluują w celu uniknięcia ludzkiej odpowiedzi immunologicznej”.
Zespół badawczy przyjrzał się czterem sezonowym ludzkim koronawirusom HCoV, ponieważ krążą one w populacji ludzkiej od 20 do 60 lat i regularnie w tym ponownie zakażając ludzi. Jest wysoce prawdopodobne, że ich białka budujące kolec, który niczym wytrych (dorobiony przez złodzieja klucz) umożliwia koronawirusom wnikanie do komórek zainfekowanego organizmu, w tym przeskok z jednego gatunku na inny, znalazły się pod presją selekcyjna, która wybiera odpowiednie mutanty, które najskuteczniej omijają odpowiedź immunologiczna.
(Szkoda, że nie wyjaśnili na czym konkretnie mogła polegać ta presja selekcyjna, co ja wywolalo. Czyzby mniejsze powinowactwo receptorów ACE2, obecnych na powierzchni ludzkich komórek, do koronawirusowego kolca u niektórych lokalnych populacji brytyjskiej i afrykańskiej? Np. niektóre mutacje w genach kodujących receptory na Limfocytach T utrudniaja, lub uniemożliwiaja przedostanie się do jego wnętrza wirusa HIV (1)
Najprawdopodobniej mutanty pojawiały się przypadkowo aż w końcu któryś zaczął skuteczniej wnikać do komórek gospodarza, skuteczniej się namnażać, tym samym zdobywać przewagę nad szczepem wyjściowym – kto pierwszy wniknie do komórki ten lepszy i to w takich ilościach!
Nowe mutacje koronawirusa czynią je bardziej zakaznymi, bo kolec ma lepsze powinowactwo (przyczepność) do receptora ACE2, co umożliwia łatwiejsze wnikanie do komórek zainfekowanego organizmu. Wirusy Szybciej i większej ilości wnikają do komórek i je niszcza.
Wyjściowa wersje koronawirusa, tego który wywołał pandemię, można przyrównać do złodzieja z kiepsko dopasowanym wytrychem, któremu udaje się otworzyć co 20 drzwi. Nowy, zmutowany szczep do złodzieja z lepiej dopasowanym kluczem, który otwiera co 5 drzwi. Który złodziej w krótkim czasie. narobi więcej spustoszeń – który szczep przeprowadzi bardziej zbiorowa oraz skuteczna inwazję paraliżując wydolność układu odpornosciowego? (2)
Takie i inne mechanizmy są odpowiedzialne za to, że osoby niezaszczepione zagrażają zaszczepionym. Osoby niezaszczepione, zwlaszcza bezobjawowe, stanowią przyjazne środowisko dla masowej replikacji i eksperymentowania z różnymi mutacjami. W końcu nowy wariant przestaje być zauważany przez wyćwiczony na danej szczepionce układ odpornościowy. Z tej przyczyny dowolnosc szczepień może pozbawić sensu cała kampanie, gdy nie wyszczepi się wymaganych 70-80 procent populacji! (3)
Ciężko się czyta teksty, w których badacze chcą upiec dwie pieczenie przy jednym ogniu. Udowodnić tezę główna i przy okazji zasadność stosowania osiągnięć biologii ewolucyjnej w takich badaniach. Ta polityczna poprawność czasami skutkuje produkowaniem niezłego bełkotu :))
Wróćmy do omawianego tekstu:
Badacze na razie nie wiedzą w jakim stopniu ponowna infekcja koronawirusami HCoV jest spowodowana osłabieniem pamięci immunologicznej, a w jakim dryfem antygenowym wirusów.
Zespół wykorzystał różne metody obliczeniowe, które dotyczą bioinformatyki, aby porównać sekwencje genetyczne wielu różnych wirusów, umożliwiające im sprawdzenie, jak się zmienialy na przestrzeni lat. Byli szczególnie zainteresowani wszelkimi zmianami, które mogły wystąpić w białkach wirusowych, które są podstawowym celem komórek odpornościowych, takich jak białka z ktorych zbudowane są kolce, znajdujące się na powierzchni koronawirusów i umożliwiające im włamywanie się do komórek gospodarza. Z uwagi na to, że są to białka powierzchniowe najbardziej narażają wirusy na atak układu odpornościowego.
Naukowcy odkryli wysokie tempo ewolucji w białkach kolców dwóch z czterech wirusów,: OC43 i 229E. Prawie wszystkie korzystne dla wirusów mutacje pojawiły się w określonym regionie białek kolca zwanym S1, która to domena umozliwia wirusowi infekowanie ludzkiech komorek. Fakt ten sugeruje, że ponowna infekcja tymi dwoma wirusami może nastąpić w wyniku dryfu antygenowego, gdy pojawi się mutacja pozwalająca uniknąć rozpoznania przez układ odpornościowy.
Zespół oszacował również, że korzystne dla skuteczności koronawirusów zmiany w białkach tworzących kolce u gatunków OC43 i 229E pojawiają się mniej więcej raz na dwa do trzech lat – około połowy do jednej trzeciej częstości obserwowanej u szczepu wirusa grypy H3N2.
„Ze względu na dużą złożoność i różnorodność HCoV nie jest do końca jasne, czy oznacza to, że inne koronawirusy, takie jak SARS-CoV-2 będą ewoluować w ten sam sposób” – wyjaśnił Trevor Bedford inny autor badań oraz członek stowarzyszony z Wydzialem Szczepionek i Chorób Zakaźnych Fred Hutchinson Cancer Research Center. „Obecne szczepionki przeciwko dzikiemu (wyjściowemu) wariantowi SARS-CoV-2 choć w znacznej mierze skuteczne mogą wymagać zmodyfikowania, żeby skutecznie zabezpieczaly przed nowymi szczepami koronawitusa. Zatem niezbędne jest ciągłe monitorowanie zmienności w białkach kolca koronawirusa, gdyż to przeciwko tym strukturom przede wszystkim projektuje się najskuteczniejsze szczepionki wymierzone w Covid-19!
ZRODLO STRESZCZENIA:
https://www.genengnews.com/news/seasonal-coronaviruses-spike-proteins-evolve-to-evade-immune-responses/
Praca zostala opublikowana 19 stycznia 2021 roku. Postawiono w niej zalozenie, ze byc moze zajdzie koniecznosc modyfikowania szcepionki ze wzgledu na nowe warianty koroawirusa. Koncze robote, a na stronie glownej wyskakuja takie informacje :)
Brytyjski wariant chińskiego koronawirusa posiada mutacje umożliwiająca skuteczniejsze omijanie obrony immunologicznej. Afrykański mutant również!
https://www.newscientist.com/article/2266429-uk-coronavirus-variant-gets-nastier-as-south-african-variant-spreads/?utm_medium=social&utm_campaign=echobox&utm_source=Facebook&fbclid=IwAR1r6wMVEeTAhH4K3DEQkWhVr3yCwMRvhDAEvAzCZx3FZMGA0PzsducERoI#Echobox=1612268627
I ta:
-Naukowcy zapowiadają, że szczepionka przeciwko nowym wariantom koronawirusa bedzie gotowa na jesień tego roku!
- Dania wprowadza cyfrowe paszporty informujace o szczepieniach. Ich właściciele będą w ten sposób dowodzić, że zostali zaszczepieni, co ułatwi im podróże służbowe.
- Izrael poszerza program szczepień o wszystkie osoby powyzej 16 roku życia:
https://www.newscientist.com/article/2237475-covid-19-news-oxford-jab-for-new-variants-could-be-ready-in-7-months/?utm_medium=social&utm_campaign=echobox&utm_source=Facebook&fbclid=IwAR05DrG73DDr-FMAabV80WkCF3ENkhZaB95GnLRvPXxKWZyJPR3V6w_vwjY#Echobox=1612375061
Za jakis czas ta:
“The Lancet”: rosyjska szczepionka obniża ryzyko objawowego COVID-19 o ponad 90 proc. [WSTĘPNE WYNIKI BADAŃ]
"Wstepne wyniki badan" :
Unia Europejska przyjęła wniosek o rejestrację rosyjskiej szczepionki Sputnik V
Rosyjska szczepionka w Polsce? Nowe informacje
Budapeszt stawia na szczepionkę z Chin i Rosji. Orbán nie ufa UE
(1)
Nabywanie odpornosci na wirusa HIV:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3074872
Tutaj o afrykańskich prostytutkach odpornych na destrukcyjny wpływ retrowirusa HIV:
https://www.jimmunol.org/content/jimmunol/164/3/1602.full.pdf
(2)
Najbardziej niepokojące mutacje w kilku wariantach koronawirusa!
https://www.scientificamerican.com/article/the-most-worrying-mutations-in-five-emerging-coronavirus-variants/?fbclid=IwAR3DvWUryV8ww72zfSOdyFHS1ROEJWpgV8KHLj76gGpDP29sm6Jx0mdd1
(3)
O tym dlaczego osoby nieszczepione stanowią poważne zagrożenie dla szczepionych. Nie z powodu, że szczepionki są nieskuteczne, tylko dlatego, że osoby niezaszczepione, zwłaszcza bezobjawowe, są inkubatorami w których patogeny (wirusy i bakterie) mogą masowo się replikować i eksperymentować z mutacjami. W efekcie może pojawić się nowy wariant, który jest odporny na szczepionke.
Obecnie naukowcy koncentrują się nad wpływem dryfu antygenowego (na powolnych zmianach mutacyjnych w czasie) w celu unikania odpowiedzi immunologicznej przez sezonowe koronawirusy. Wykazali, że dwa sezonowe ludzkie koronawirusy przechodzą transformacje adaptacyjna w obszarach białka zwanego kolcem, które to struktury są najbardziej eksponowane, tym samym narażone na odpowiedź uladu odpornosciowego
( za odpowiedź humoralną). Odkrycia sugerują, że może być konieczna ciągła zmiana składu szczepionek na koronawirusa.
Istmnieją setki gatunków koronawirusów infekujacych takie zwierzęta, jak nietoperze, koty, świnie i wielbłądy. Jak dotąd wiadomo, że siedem różnych koronawirusów infekuje ludzi. Koronawirusy, które często infekują ludzi powodując łagodny przebieg zakażen, które prawdopodobnie przypomina zwykłe przeziębienie, to 229E, NL63, OC43 i HKU1. Druga, bardziej znana grupa składa się z MERS-CoV, SARS-CoV i SARS-CoV-2.
Wiadomo, że niektóre koronawirusy ponownie infekują ludzi, ale nie jest jasne w jakim stopniu jest to spowodowane naturalnym zanikiem ludzkiej pamięci immunologicznej, a na ile dryfem antygenów” – powiedziała autorka badań Kathryn Kistler, doktorantka z Vaccine and Infectious Disease Division Fred Hutchinson Cancer Research Centrum w Seattle, dodając: „Chcieliśmy zbadać, czy istnieją dowody na to, że koronawirusy związane z SARS-CoV-2 (mutanty wywodzące się od chińskiego szczepu, który rozpoczął pandemię) ewoluują w celu uniknięcia ludzkiej odpowiedzi immunologicznej”.
Zespół badawczy przyjrzał się czterem sezonowym ludzkim koronawirusom HCoV, ponieważ krążą one w populacji ludzkiej od 20 do 60 lat i regularnie w tym ponownie zakażając ludzi. Jest wysoce prawdopodobne, że ich białka budujące kolec, który niczym wytrych (dorobiony przez złodzieja klucz) umożliwia koronawirusom wnikanie do komórek zainfekowanego organizmu, w tym przeskok z jednego gatunku na inny, znalazły się pod presją selekcyjna, która wybiera odpowiednie mutanty, które najskuteczniej omijają odpowiedź immunologiczna.
(Szkoda, że nie wyjaśnili na czym konkretnie mogła polegać ta presja selekcyjna, co ja wywolalo. Czyzby mniejsze powinowactwo receptorów ACE2, obecnych na powierzchni ludzkich komórek, do koronawirusowego kolca u niektórych lokalnych populacji brytyjskiej i afrykańskiej? Np. niektóre mutacje w genach kodujących receptory na Limfocytach T utrudniaja, lub uniemożliwiaja przedostanie się do jego wnętrza wirusa HIV (1)
Najprawdopodobniej mutanty pojawiały się przypadkowo aż w końcu któryś zaczął skuteczniej wnikać do komórek gospodarza, skuteczniej się namnażać, tym samym zdobywać przewagę nad szczepem wyjściowym – kto pierwszy wniknie do komórki ten lepszy i to w takich ilościach!
Nowe mutacje koronawirusa czynią je bardziej zakaznymi, bo kolec ma lepsze powinowactwo (przyczepność) do receptora ACE2, co umożliwia łatwiejsze wnikanie do komórek zainfekowanego organizmu. Wirusy Szybciej i większej ilości wnikają do komórek i je niszcza.
Wyjściowa wersje koronawirusa, tego który wywołał pandemię, można przyrównać do złodzieja z kiepsko dopasowanym wytrychem, któremu udaje się otworzyć co 20 drzwi. Nowy, zmutowany szczep do złodzieja z lepiej dopasowanym kluczem, który otwiera co 5 drzwi. Który złodziej w krótkim czasie. narobi więcej spustoszeń – który szczep przeprowadzi bardziej zbiorowa oraz skuteczna inwazję paraliżując wydolność układu odpornosciowego? (2)
Takie i inne mechanizmy są odpowiedzialne za to, że osoby niezaszczepione zagrażają zaszczepionym. Osoby niezaszczepione, zwlaszcza bezobjawowe, stanowią przyjazne środowisko dla masowej replikacji i eksperymentowania z różnymi mutacjami. W końcu nowy wariant przestaje być zauważany przez wyćwiczony na danej szczepionce układ odpornościowy. Z tej przyczyny dowolnosc szczepień może pozbawić sensu cała kampanie, gdy nie wyszczepi się wymaganych 70-80 procent populacji! (3)
Ciężko się czyta teksty, w których badacze chcą upiec dwie pieczenie przy jednym ogniu. Udowodnić tezę główna i przy okazji zasadność stosowania osiągnięć biologii ewolucyjnej w takich badaniach. Ta polityczna poprawność czasami skutkuje produkowaniem niezłego bełkotu :))
Wróćmy do omawianego tekstu:
Badacze na razie nie wiedzą w jakim stopniu ponowna infekcja koronawirusami HCoV jest spowodowana osłabieniem pamięci immunologicznej, a w jakim dryfem antygenowym wirusów.
Zespół wykorzystał różne metody obliczeniowe, które dotyczą bioinformatyki, aby porównać sekwencje genetyczne wielu różnych wirusów, umożliwiające im sprawdzenie, jak się zmienialy na przestrzeni lat. Byli szczególnie zainteresowani wszelkimi zmianami, które mogły wystąpić w białkach wirusowych, które są podstawowym celem komórek odpornościowych, takich jak białka z ktorych zbudowane są kolce, znajdujące się na powierzchni koronawirusów i umożliwiające im włamywanie się do komórek gospodarza. Z uwagi na to, że są to białka powierzchniowe najbardziej narażają wirusy na atak układu odpornościowego.
Naukowcy odkryli wysokie tempo ewolucji w białkach kolców dwóch z czterech wirusów,: OC43 i 229E. Prawie wszystkie korzystne dla wirusów mutacje pojawiły się w określonym regionie białek kolca zwanym S1, która to domena umozliwia wirusowi infekowanie ludzkiech komorek. Fakt ten sugeruje, że ponowna infekcja tymi dwoma wirusami może nastąpić w wyniku dryfu antygenowego, gdy pojawi się mutacja pozwalająca uniknąć rozpoznania przez układ odpornościowy.
Zespół oszacował również, że korzystne dla skuteczności koronawirusów zmiany w białkach tworzących kolce u gatunków OC43 i 229E pojawiają się mniej więcej raz na dwa do trzech lat – około połowy do jednej trzeciej częstości obserwowanej u szczepu wirusa grypy H3N2.
„Ze względu na dużą złożoność i różnorodność HCoV nie jest do końca jasne, czy oznacza to, że inne koronawirusy, takie jak SARS-CoV-2 będą ewoluować w ten sam sposób” – wyjaśnił Trevor Bedford inny autor badań oraz członek stowarzyszony z Wydzialem Szczepionek i Chorób Zakaźnych Fred Hutchinson Cancer Research Center. „Obecne szczepionki przeciwko dzikiemu (wyjściowemu) wariantowi SARS-CoV-2 choć w znacznej mierze skuteczne mogą wymagać zmodyfikowania, żeby skutecznie zabezpieczaly przed nowymi szczepami koronawitusa. Zatem niezbędne jest ciągłe monitorowanie zmienności w białkach kolca koronawirusa, gdyż to przeciwko tym strukturom przede wszystkim projektuje się najskuteczniejsze szczepionki wymierzone w Covid-19!
ZRODLO STRESZCZENIA:
https://www.genengnews.com/news/seasonal-coronaviruses-spike-proteins-evolve-to-evade-immune-responses/
Praca zostala opublikowana 19 stycznia 2021 roku. Postawiono w niej zalozenie, ze byc moze zajdzie koniecznosc modyfikowania szcepionki ze wzgledu na nowe warianty koroawirusa. Koncze robote, a na stronie glownej wyskakuja takie informacje :)
Brytyjski wariant chińskiego koronawirusa posiada mutacje umożliwiająca skuteczniejsze omijanie obrony immunologicznej. Afrykański mutant również!
https://www.newscientist.com/article/2266429-uk-coronavirus-variant-gets-nastier-as-south-african-variant-spreads/?utm_medium=social&utm_campaign=echobox&utm_source=Facebook&fbclid=IwAR1r6wMVEeTAhH4K3DEQkWhVr3yCwMRvhDAEvAzCZx3FZMGA0PzsducERoI#Echobox=1612268627
I ta:
-Naukowcy zapowiadają, że szczepionka przeciwko nowym wariantom koronawirusa bedzie gotowa na jesień tego roku!
- Dania wprowadza cyfrowe paszporty informujace o szczepieniach. Ich właściciele będą w ten sposób dowodzić, że zostali zaszczepieni, co ułatwi im podróże służbowe.
- Izrael poszerza program szczepień o wszystkie osoby powyzej 16 roku życia:
https://www.newscientist.com/article/2237475-covid-19-news-oxford-jab-for-new-variants-could-be-ready-in-7-months/?utm_medium=social&utm_campaign=echobox&utm_source=Facebook&fbclid=IwAR05DrG73DDr-FMAabV80WkCF3ENkhZaB95GnLRvPXxKWZyJPR3V6w_vwjY#Echobox=1612375061
Za jakis czas ta:
“The Lancet”: rosyjska szczepionka obniża ryzyko objawowego COVID-19 o ponad 90 proc. [WSTĘPNE WYNIKI BADAŃ]
"Wstepne wyniki badan" :
Unia Europejska przyjęła wniosek o rejestrację rosyjskiej szczepionki Sputnik V
Rosyjska szczepionka w Polsce? Nowe informacje
Budapeszt stawia na szczepionkę z Chin i Rosji. Orbán nie ufa UE
(1)
Nabywanie odpornosci na wirusa HIV:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3074872
Tutaj o afrykańskich prostytutkach odpornych na destrukcyjny wpływ retrowirusa HIV:
https://www.jimmunol.org/content/jimmunol/164/3/1602.full.pdf
(2)
Najbardziej niepokojące mutacje w kilku wariantach koronawirusa!
https://www.scientificamerican.com/article/the-most-worrying-mutations-in-five-emerging-coronavirus-variants/?fbclid=IwAR3DvWUryV8ww72zfSOdyFHS1ROEJWpgV8KHLj76gGpDP29sm6Jx0mdd1
(3)
O tym dlaczego osoby nieszczepione stanowią poważne zagrożenie dla szczepionych. Nie z powodu, że szczepionki są nieskuteczne, tylko dlatego, że osoby niezaszczepione, zwłaszcza bezobjawowe, są inkubatorami w których patogeny (wirusy i bakterie) mogą masowo się replikować i eksperymentować z mutacjami. W efekcie może pojawić się nowy wariant, który jest odporny na szczepionke.
0 new messages