Наверное. У меня так:
    tony@thinkx201:/tmp> CXXFLAGS="-DMY_PTHREAD_FASTMUTEX"
    ./configure --with-mysql=/path/to/mariadb-5.5.31-sources/
    bash: ./configure: No such file or directory
    
    Может, у вас шелл какой-то ..ээ.. альтернативный и там не так
    переменные надо указывать?
    
    Вообще, не совсем ясно почему вы только эту опцию указываете. Марию
    собирали вы сами или брали готовые пакеты?
    Если сами, то те же исходники и указывайте при сборке модуля (или
    исходники, сконфигурированные с теми же опциями).
    Если это чьи-то пакеты, то надо искать как там всё собиралось.
    
-- 
Wbr,
Antony Dovgal
---
http://pinba.org - realtime profiling for PHP