Slach, спасибо огромное за ответ :)
На самом деле без разницы в какой момент времени собирать данные =) Главное делать это с той же периодичностью, что и pinba_stats_history=N
Так как пинба хранит в любой момент времени данные за последние N секунд.
Пусть N = 300 и если запросим в 00:06 и получим данные за 00:01-00:06, запросим в 00:08 получим данные за 00:03-00:08
С уважением,
Паша