Junto con el diseño de una Política Nacional de CTI, es necesario adoptar un sistema competente de generación de políticas, planes y programas que garantice además una buena ejecución de los mismos. Este sistema debe incluir los instrumentos necesarios para una evaluación oportuna y rigurosa tanto de los resultados como del impacto de los programas y políticas que se implementen. Los métodos de evaluación deben reconocer las diferencias entre las disciplinas de investigación, respetando las demandas diferenciales de tiempo, recursos económicos y humanos.