Como Baixar O Programa Rstudio
Thomas
Felizmente existem diversas pessoas que se empenharam em fazer interfaces mais elaboradas para o R, que no alteram como o programa funciona (ou seja, no alteram em nada a linguagem), mas ajudam o programador a ter um melhor controle e visualizao sobre o cdigo que ele est escrevendo. Uma dessas interfaces o Tinn-R, por exemplo. H pouco tempo atrs, uma nova interface chamada RStudio foi lanada, com diversas propriedades que ajudam muito quem est programando, e principalmente, quem nunca usou o R antes. Alm disso, o funciona da mesma forma em todas as plataformas. Essa ser a interface que vamos utilizar.
Se voc no encontrou um pacote pr-compilado do para sua distribuio especfica, ou, se voc quer instalar o compilando o cdigo-fonte, siga as instrues abaixo. Compilar o cdigo-fonte oferece uma srie de vantagens como a personalizao da instalao, e um ganho de performance do programa quando comparado com verses pr-compiladas.
Coloque esse arquivo em um diretrio de sua escolha, abra um terminal e acesse esse diretrio (usando cd). Por exemplo, se o arquivo estiver dentro de um diretrio chamado Programas, no diretrio padro do usurio
Coletamos dados para a partir das informaes contidas neles respondermos perguntas sobre fenmenos ou processos de nosso interesse. Para isso, fazemos uso de conceitos e tcnicas estatsticas, desde o planejamento do processo de coleta at a anlise dos dados e apresentao dos resultados. Todo este trabalho realizado com a utilizao de softwares que nos auxiliam tanto no planejamento da coleta e anlise dos dados, como na visualizao e interpretao dos resultados. A grande maioria dos softwares estatsticos possuem uma licena de uso relativamente cara, o que torna seu acesso bastante limitado. Dessa forma, nos dias de hoje, empresas, universidades e instituies esto recorrendo ao uso de ambientes de programao de carter gratuito, como o R e o Python.
O R uma linguagem de programao sofisticada, alm de ser um ambiente de anlises estatsticas, confeco de grficos, produo de documentos e relatrios, criao de sites interativos e aplicativos. Dentre as suas vantagens, podemos destacar a sua adaptao aos sistemas operacionais Linux, Mac OS e Windows; um programa de cdigo livre, desenvolvido por seus prprios usurios, que criam documentos facilmente reprodutveis e modificveis. Alm disso, possui uma comunidade de usurios ao redor do mundo bastante extensa e ativa, que todos os dias desenvolvem novas funcionalidades para o programa e oferecem solues para as diversas dvidas que possam surgir.
O uso do software R facilitado quando utilizamos o software RStudio, um ambiente de desenvolvimento integrado ao R, que apresenta uma interface grfica mais amigvel para o R, com muitos recursos teis que facilitam a visualizao do cdigo R, a importao de conjunto de dados, a visualizao de figuras, etc.
Neste texto apresentamos uma introduo ao uso do software R atravs da interface RStudio, com objetivo de apresentar e introduzir os alunos da disciplina Fundamentos de Estatstica e Cincias de Dados no uso destas ferramentas para anlise estatstica de dados.
Este documento fornece instrues passo-a-passo sobre como instalar e usar o software RStudio para anlises estatsticas. Ele explica como baixar e instalar o R e o RStudio, importar e organizar dados, rodar scripts, instalar pacotes, exportar resultados e grficos, e limpar a memria do computador.Read less
Este apndice descreve o passo a passo para a instalao do R, de um programa que oferece um ambiente integrado de desenvolvimento baseado no R (RStudio), e de um pacote que fornece uma interface grfica para a utilizao do R (R Commander).
O R uma linguagem e um ambiente para a realizao de anlises estatsticas e construo de grficos e altamente extensvel. R disponvel como software livre sob os termos da Licena Pblica Geral GNU da Free Software Foundation.
O R possui as seguintes caractersticas:
- alm de gratuito, um programa poderoso, estvel e pode ser copiado e distribudo sem nenhum problema;
- um programa que tem uma longa histria, com mais de 25 anos de desenvolvimento;
- apoiado por uma grande equipe de desenvolvedores em todo o mundo;
- pode ser usado nos sistemas operacionais Windows, Linux e Mac OS;
- amplamente utilizado no meio acadmico.
As sees seguintes descrevem o passo a passo para a instalao do R, de um programa que oferece um ambiente integrado de desenvolvimento baseado no R (RStudio), e de um pacote que fornece uma interface grfica para a utilizao do R (R Commander - Rcmdr).
Para um usurio iniciante no R, vamos utilizar um pacote que oferece uma interface grfica para realizar anlises estatsticas, criar grficos, carregar, manipular, importar ou exportar conjuntos de dados. Esse pacote chamado de R Commander (Rcmdr).
Pronto! O R j pode ser utilizado. Apesar de o R poder ser utilizado exclusivamente a partir de sua instalao, neste livro, sempre ser utilizado o R Commander, ou o RStudio, eventualmente acompanhado do R Commander.
Ao baixar o instalador, basta execut-lo que o programa ser instalado. Aps a instalao, para executar o RStudio, basta selecion-lo na lista de aplicaes ou clicar em seu cone na rea de trabalho. Ao iniciar o RStudio, automaticamente os pacotes bsicos do R so carregados, no sendo necessrio executar o R a partir do menu ou rea de trabalho.
possvel instalar o pacote R Commander, e qualquer outro pacote do R, a partir do RStudio. Caso j tenha instalado o R Commander na seo A.3, no necessrio executar os passos mostrados abaixo, mas aconselhamos a leitura para entender como instalar um pacote do R a partir do RStudio.
A execuo de comandos via R Commander um pouco diferente do que no RStudio. Na aba R Script, digitamos o comando e clicamos no boto Submeter (figura A.18). Os resultados da execuo do comando (se houver), e eventuais mensagens de erro iro ser mostradas na console do RStudio (figura A.19). Nesse caso, no houve nenhum resultado a ser exibido, nem mensagens de erro.
Observao:
O R Commander pode ser tambm utilizado a partir da tela inicial do R, sem utilizar o RStudio. Para isso, digitamos o comando library(Rcmdr) aps o sinal de prompt na tela de entrada do R (figura A.22) e pressionamos a tecla Enter. Nesse caso, duas outras sees sero exibidas na tela do R Commander: Resultados e Mensagens. Os grficos sero exibidos na janela do R.
Aqui voc vai aprender como iniciar a sua investigao, o nosso tutorial vai te explicar como obter as informaes em 2D e ainda vai demonstrar alguns exemplos de anlises mais bsicas (e efetivas) que podem ser realizadas! Antes de comearmos necessrio que voc conhea um pouco sobre o funcionamento da anlise, se voc j conhece um pouco pode avanar para a Etapa 01. Agora, se voc precisa aprender um pouco mais sobre o tema e a ferramenta, leia no nosso texto de apresentao:
O programa que iremos utilizar o R e ele funciona por linhas de comando. Isso pode parecer estranho, mas garantimos que o resultado formidvel. Provavelmente em algum momento voc j deve ter escutado falar desse programa, agora voc ir conhec-lo:
Para acompanhar esse tutorial necessrio realizar a instalao de alguns complementos ao R, esses complementos so chamados comumente de pacotes. Os pacotes contm blocos de informaes necessrias para que o R possa realizar clculos especficos, entender como interpretar e apresentar os resultados ao usurio.
Agora que voc digitou o nome do pacote basta clicar em Install e o RStudio ir baixar e instalar os pacotes. O tempo de download variado, isso vai depender de qual servidor o RStudio ir fazer o download e qual a largura de banda de sua internet ;)
O processo de digitalizao de landmarks no RStudio foi implementado por Olsen e Westneat, em 2014. De l pra c algumas atualizaes ocorreram, um dos autores mantm um site atualizado onde constam tutoriais de digitalizao de landmarks em estruturas 2D e 3D, fique a vontade para explorar e conhecer um pouco mais do trabalho dos autores:
Como dissemos antes, o R um programa de linha de comandos e dessa maneira tudo deve estar no seu lugar antes de comear. Cada detalhe conta e cada caractere crucial para o pleno funcionamento. Voc deve sempre prestar ateno em cada letra digitada. Assim, vamos iniciar:
Uma interface ir abrir, marque suas preferncias. Depois s marcar os seus landmarks e ao final da marcao em cada foto, clique em Salvar e depois em Avanar para dar incio a marcao dos landmarks na prxima imagem. Ao fim, clique em Exit.
Agora que temos as nossas informaes de coordenadas, vamos realizar a GPA. Este processo ir escalonar, rotacionar e sobrepor todas as coordenadas. Isto crucial em todas as anlises de morfometria geomtrica, visto que tambm nesse momento que obtemos o isolamento da forma e do tamanho da estrutura investigada.
1 - Converta os dados do pacote StereoMorph para o pacote Geomorph. Neste passo, os dados de coordenadas obtidos com o StereoMorph so convertidos para o modo de leitura do Geomorp. As coordenadas convertidas sero salvas em coordenadas_vista_gm (note que ser criado um objeto com este no menu direito). Digite:
Antes de realizar a PCA necessrio que preparemos o ambiente do RStudio para que tenhamos mo todas as informaes necessrias. Primeiro vamos criar um local no RStudio que tenha as informaes de coordenadas isoladas de qualquer outro conjunto de dados.
Aps digitar o ltimo comando a PCA ser calculada e uma lista de informaes ser obtida. Nesse momento, as informaes de cada PC calculado ser exposta a voc, recomendamos que tire um printscreen da tela ou salve os valores de cada PC como desejar.
Aps criar o objeto classificadores_pca (Item 2, Etapa 4), necessrio criar um banco de dados chamado de df_forma, que um objeto contendo os classificadores_pca mais os valores da PCA que foram calculados. Isso necessrio para criar o plot (grfico) da PCA. Note: [, 1:2] significam PCA 1 e PCA 2 respectivamente. Digite:
O mais legal da morfometria geomtrica poder simular e visualizarcomo as formas variam, no mesmo? Ns amamos quando vemos as grades de deformao (grids) nos artigos cientficos! Agora vamos te ensinar a fazer as suas prprias grades. Digite:
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