关于Xcrysden的使用

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Apr 20, 2009, 11:29:05 AM4/20/09
to OpenMx交流
Xcrysden可以显示我们建立的立体模型,也可以通过标准.xyz文件或标准gaussian文件显示OpenMx计算出的电荷密
度图和自旋分布图等。同时,Xcrysden也提供了k点选取的功能,可以给出我们所选的k点坐标。

作为例子,一种标准的.xsf格式的输入文件如下,注意关键字之前的空格,修改其中具体坐标,即可显示出模型结构。.xsf和.xyz
与.cube(gaussian格式)文件可直接在File/Open Structure中选择打开。
CRYSTAL
PRIMVEC
6.4985 0 0
-3.24925 5.627701 0
0 0 10.4109
PRIMCOORD
32 2
30 -0.000000000 1.875966909 -0.000000000
8 -0.000000000 1.875966909 1.991601344
30 1.624635000 0.937983455 2.602720000
8 1.624635000 0.937983455 4.594321344
30 3.249270000 1.875966909 -0.000000000
8 3.249270000 1.875966909 1.991601344
```原子坐标```

Xcrysden的k点功能和密度图显示功能在tools中。k点只需在显示的倒空间结构图中点击选择特殊点得到其坐标。具体如何应用于
OpenMx输入,在另一文中已有介绍。画密度图应用了Xcrysden的data grid功能,可以显示三个平面的密度图和立体的电子云面图。

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