Solucionado. Era más fácil de lo que pensaba. Tan solo tengo que importar mi archivo original de apuntes.
1 cambio los datos de mis archivo con los IDS de las tablas de ODOO que previamente e exportado para identificarlos. (ID cliente, ID impuesto, ID cuenta contable, etc...)
2 Por cada grupo de lineas que corresponden a un asiento, solo dejo la cabecera del asiento en una de las lineas, el resto de cabeceras las elimino de cada una de las lineas del asiento. (ojo, solo la cabecera, el resto de datos del apunte los dejo)
3 Reemplazo las "," por "." en los campos de importe.
4 En los campos de fecha, personalizo el formato de fecha a "aaaa-mm-dd"
5 Guardo en formato CSV, si no lo había realizado anteriormente.
6 Lo abro con procesador de textos y lo vuelvo a guardar en formato UTF-8
...y creo que esto es todo.