1)Java6=JRE1.6ですので、Java(TM) SE Runtime Environment 6以上であれば何でも良いと言ってますね。
ちなみにJava6は今のところJava SE Runtime Environment 6u31までいってますので、これでも良いかと思います。
Oracleのサイトでは「最新バージョンの Java には、旧バージョンに対するアップデートと修正が含まれているので、必ず最新バージョンを使用
してください」と言ってますので、最新を入れておけば良いと思います。
2)これはこのツールへの質問というより、Javaに関する質問のようなのでネット上を検索してコピペします↓
「JRE, JDK はそれぞれ Java Runtime Environment, Java Development Kit の略で、
前者は、JDK をベースに作られた Java のプログラムを実行する際に必要になる JVMと
クラスライブラリのパッケージで、後者は、開発者向けのコンパイラなどのツールと
クラスライブラリのパッケージです。
Java 2以降では、JDKをSDK(Software Development Kit)と呼ぶようになりました。
SDKにはJREが含まれているので、SDKを導入した開発者は別途JREを入手して導入する
必要はありません。」
3)Oracleのサイトでは「最新バージョンの Java には、旧バージョンに対するアップデートと修正が含まれているので、必ず最新バージョンを
使用してください」と言ってます。