hola:
en principio, es difícil saber lo que pueda estar causando el problema al guardar.
de todas maneras sí creo notar que:
- el nombre del archivo de la escena contiene una coma (,) intentaría no incluir ese tipo de caracteres en los nombres de archivo, porque podría ser problemático.
- no estás guardando los archivos en una carpeta estándar de proyecto de OpenToonz (que contenga las subcarpetas drawings, extras, inputs, outputs, palettes, scenes, etc).
luego, si cerraste el programa Descartando los cambios, en ese caso la información que había en la sesión se debe haber perdido al cerrar el programa.
finalmente, sin más datos va a ser difícil poder darte más ayuda. si en algún momento tenés la posibilidad de enviar alguna otra información relevante del proyecto, que pueda servir para acotar más las particularidades de tu caso, eso podría ser de ayuda.
saludos,
g