lo que dice Jorge es correcto, pero sería en Planilla > Opciones de escena... en donde se controla la opacidad del fondo de la escena. (de todas maneras de forma predefinida ya está en 0)
para comprobar si el fondo de tu escena es efectivamente transparente podés activar la previsualización del visor y cambiarle el fondo a Damero, como te indico en la imagen.