Negative frequencies

45 views
Skip to first unread message

Mariana H

unread,
Nov 23, 2021, 8:03:37 AM11/23/21
to nwchem...@googlegroups.com
Dear all,

I have a question regarding a frequency calculation in NwChem. I optimised a Cl-BsubPc molecule and reached a minimum that also agrees well with experimental data. However, when running a frequency calculation, I obtain three negative frequencies:

 ----------------------------------------------------------------------------
 Normal Eigenvalue ||           Projected Infra Red Intensities
  Mode   [cm**-1]  || [atomic units] [(debye/angs)**2] [(KM/mol)] [arbitrary]
 ------ ---------- || -------------- ----------------- ---------- -----------
    1     -199.878 ||    0.000773           0.018         0.753       0.426
    2     -199.855 ||    0.000774           0.018         0.755       0.427
    3      -90.562 ||    0.003152           0.073         3.072       1.738
    4       -0.000 ||    0.000000           0.000         0.000       0.000
    5       -0.000 ||    0.000259           0.006         0.252       0.143
    6       -0.000 ||    0.000008           0.000         0.007       0.004
    7       -0.000 ||    0.000266           0.006         0.259       0.147
    8       -0.000 ||    0.000000           0.000         0.000       0.000
    9        0.000 ||    0.000002           0.000         0.002       0.001
   10       75.295 ||    0.000294           0.007         0.287       0.162
   11       75.341 ||    0.000296           0.007         0.289       0.163
   12      127.092 ||    0.000000           0.000         0.000       0.000
   13      137.566 ||    0.001530           0.035         1.491       0.843
   14      137.581 ||    0.001526           0.035         1.488       0.841
   15      161.465 ||    0.002184           0.050         2.129       1.204
   16      161.490 ||    0.002186           0.050         2.131       1.205
   17      192.422 ||    0.000405           0.009         0.395       0.223
   18      231.180 ||    0.000000           0.000         0.000       0.000
   19      250.919 ||    0.002884           0.067         2.811       1.590
   20      250.921 ||    0.002891           0.067         2.818       1.594
   21      296.542 ||    0.008318           0.192         8.109       4.586
   22      321.871 ||    0.003929           0.091         3.830       2.166
   23      321.919 ||    0.003936           0.091         3.837       2.170
   24      337.794 ||    0.000111           0.003         0.108       0.061
   25      337.916 ||    0.000097           0.002         0.094       0.053
   26      346.734 ||    0.000904           0.021         0.882       0.499
   27      410.295 ||    0.019077           0.440        18.597      10.518
   28      432.464 ||    0.000000           0.000         0.000       0.000
   29      442.411 ||    0.000014           0.000         0.013       0.007
   30      442.420 ||    0.000015           0.000         0.014       0.008
   31      451.111 ||    0.019219           0.443        18.735      10.596
   32      513.228 ||    0.000322           0.007         0.314       0.178
   33      513.255 ||    0.000324           0.007         0.315       0.178
   34      526.748 ||    0.004802           0.111         4.682       2.648
   35      526.799 ||    0.004785           0.110         4.664       2.638
   36      580.695 ||    0.000000           0.000         0.000       0.000
   37      581.901 ||    0.013502           0.312        13.163       7.444
   38      581.909 ||    0.013513           0.312        13.173       7.450
   39      629.555 ||    0.000000           0.000         0.000       0.000
   40      641.855 ||    0.001187           0.027         1.157       0.654
   41      641.859 ||    0.001195           0.028         1.165       0.659
   42      649.522 ||    0.021861           0.504        21.311      12.052
   43      653.732 ||    0.000000           0.000         0.000       0.000
   44      664.975 ||    0.003004           0.069         2.929       1.656
   45      664.981 ||    0.003010           0.069         2.935       1.660
   46      720.941 ||    0.000717           0.017         0.699       0.395
   47      730.957 ||    0.006835           0.158         6.663       3.768
   48      730.961 ||    0.006774           0.156         6.604       3.735
   49      746.408 ||    0.018805           0.434        18.332      10.368


I tried switching to task dft freq numerical and to increase the grid size to huge, however so far I could not solve the problem. Also, I tried switching from the diffuse aug-cc-pvtz basis set I was previously using to a more simple basis set in order to see if it has any influence, but that does not seem to be the case. 

This is my latest input file:

echo
start CO+_PBE
title CO+_PBE



geometry units angstroms noautosym
C     0.93520996    -3.19627517    -0.20235192
C    -0.05351249    -2.27523883     0.32130452
N     0.64990810    -1.18986760     0.73467027
C     1.94297049    -1.18545320     0.32006234
C     2.18231520    -2.51549043    -0.20322501
C    -3.27007016    -0.63247187    -0.19836462
C    -3.23616185     0.78791571    -0.19809140
C    -1.94350674     1.18390356     0.32382568
N    -1.35498553     0.03222664     0.73774365
C    -1.99783321    -1.08989776     0.32350637
N     0.70599042     1.15713852     0.73488141
C     0.05523335     2.27505238     0.32201490
C     1.08684097     3.14797977    -0.20128025
C     2.30001979     2.40841285    -0.20235705
C     1.99740518     1.09112240     0.32041675
C     3.31573007    -3.11746282    -0.73402408
C     3.19953158    -4.40219792    -1.23215501
C     1.97097088    -5.07298464    -1.23107392
C     0.82806143    -4.47564796    -0.73195973
C     1.04096809     4.43128281    -0.73021819
C     2.21114614     4.97356816    -1.22902026
C     3.40627999     4.24487276    -1.23031662
C     3.46096664     2.95585238    -0.73270690
C    -4.35850076    -1.31332247    -0.72797847
C    -5.41349760    -0.57056459    -1.22546843
C    -5.38011116     0.82877726    -1.22515115
C    -4.29085891     1.52014751    -0.72740420
B     0.00112769    -0.00025285     1.33531178
N     2.64848558    -0.06337965     0.19035494
N    -1.26947462     2.32508432     0.19388921
N    -1.37906909    -2.26192680     0.19320027
Cl    0.00380704    -0.00038428     3.19261564
H     4.26147442    -2.59102208    -0.74956964
H     4.07290077    -4.89981566    -1.63552740
H     1.91680063    -6.07703802    -1.63362334
H    -0.12616350    -4.98659053    -0.74582592
H     0.11225654     4.98727842    -0.74385972
H     2.20503185     5.97927495    -1.63106530
H     4.30246133     4.70043330    -1.63337209
H     4.38048412     2.38481931    -0.74843170
H    -4.37550077    -2.39558070    -0.74289388
H    -6.28149401    -1.07831306    -1.62780926
H    -6.22290307     1.37753428    -1.62723412
H    -4.25622454     2.60199531    -0.74185603
end
BASIS PRINT
* library 6-31g
end


dft
direct
vectors output CO+.movecs
xc pbe0
convergence diis 5
grid huge
convergence energy     1e-8
convergence gradient   1e-6
convergence density    1e-6
iterations 300
end

task dft energy

freq
reuse
end

task dft freq numerical





Could you please advise me on this? 


Best wishes, Mariana. 


Edoardo Aprà

unread,
Nov 23, 2021, 7:18:07 PM11/23/21
to NWChem Forum
This is slightly modified input that will give you zero negative frequencies
echo
start CO+_PBE
title CO+_PBE

memory total 2000 mb noverify


geometry units angstroms# noautosym
BASIS spherical PRINT

* library 6-31g
end

dft
 sym off
 adapt off
 direct
 xc pbe0
 tolerances acccoul 13
 grid fine
end

driver
 tight
 clear
end

task dft energy optimize

dft
 grid huge
end

task dft freq

Reply all
Reply to author
Forward
0 new messages