Duarte,
Os prints não me dizem nada. Instalar o MikTeX não significa que esteja atualizado. É preciso depois atualizar a instalação com a versão mais recente dos pacotes. Insisto que depois disso deverá funcionar.
Por favor confirma que realmente atualizaste todos os pacotes da instalação antes de tentares processar de novo o template.
Podes também colocar o problema no grupo do facebook, que tem mais gente, e pode ser que alguém tenha tido o mesmo problema e te possa ajudar mais (e melhor) do que eu.
João Lourenço