Así lo tengo en CentOS...
*Instalar NDOUtils
/]# cd /tmp
tmp]# yum -y install ndoutils
tmp]# wget
http://sourceforge.net/projects/nagios/files/ndoutils-1.x/ndoutils-1.4b9/ndoutils-1.4b9.tar.gz/download
tmp]# tar -xvzf ndoutils-1.4b9.tar.gz
tmp]# cd ndoutils-1.4b9
## Acá es importante saber si es de 64bit, puesto que el siguiente comando sería:
# ndoutils-1.4b9]# cvs -z3 -d:pserver:anon...@nagios.cvs.sourceforge.net:/cvsroot/nagios co -P ndoutils
# ndoutils-1.4b9]# ./configure -with-mysql-lib=/usr/lib64/mysql
## Si es 32 bit sería solo:
# ndoutils-1.4b9]# ./configure
## Para ambos casos continua...
(en algunos casos no funciona, lo de 64bit, si es así, solo dele "./configure")
ndoutils-1.4b9]# make
ndoutils-1.4b9]# cd db/
db]# ./installdb -u nagios -p nagios -h localhost -d nagios
db]# cd ..
ndoutils-1.4b9]# cp src/ndomod-3x.o /usr/local/nagios/bin/ndomod.o
ndoutils-1.4b9]# cp config/ndomod.cfg-sample /etc/nagios/ndomod.cfg
ndoutils-1.4b9]# cp src/ndo2db-3x /usr/local/nagios/bin/ndo2db
ndoutils-1.4b9]# cp config/ndo2db.cfg-sample /etc/nagios/ndo2db.cfg
## Lo siguiente no es necesario.
ndoutils-1.4b9]# cp src/ndomod-3x.o /usr/bin/ndomod.o
ndoutils-1.4b9]# cp src/ndo2db-3x /usr/bin/ndo2db
## Por ultimo arrancamos el servicio.
/usr/local/nagios/bin/ndo2db -c /etc/nagios/ndo2db.cfg
## ó
/usr/bin/ndo2db -c /etc/nagios/ndo2db.cfg