Molpro2020.2 memory specification error

294 kali dilihat
Langsung ke pesan pertama yang belum dibaca

Kristian Holten Møller

belum dibaca,
18 Mei 2021, 02.04.4218/05/21
kepadamolpro-user
Hi everyone, 

I am trying to understand an error message related to memory specification for larger calculations in Molpro2020.2. In this specific case, it is a CCSD(T)-F12a/VDZ-F12 single point calculation on an open-shell C6H14NO5 system, but I have experienced similar errors for other systems. 

For simplicity, I specify my memory using "-M 48g", providing what I think should be plenty of memory for the job. And I allow the calculation 400 GB of RAM on my cluster.

However, at the top of my Molpro output file, much less memory seems to be specified, as shown below. Does anyone know why this happens?

**********
 Memory per process:      1000 MW
 Total memory per node:   5800 MW
 Total GA space:          4800 MW

 GA preallocation disabled
 GA check enabled

 Geometry recognized as XYZ


 Variable memory set to 1000.0 MW
**********

My calculation fails with the error message below related to memory, but it is different from the memory error messages I have been used to seeing in Molpro 2012. Does this error message relate to insufficient memory for Global Arrays? In that case, I could possibly circumvent it by manually dividing the available memory between Molpro and GA, but I thought that not having to do that was the advantage of using "-M" to specify memory? I'm writing the submission script for my whole group and thus wanted it to be as general as possible. 

Best, 
Kristian H. Møller
Postdoc
University of Copenhagen

**********
 PROGRAM * CCSD (Restricted open-shell coupled cluster)     Authors: C. Hampel, H.-J. Werner, 1991, M. Deegan, P.J. Knowles, 1992

                   Density fitting integral evaluation by F.R. Manby, 2003,2007, G. Knizia, 2010


 Basis set AUG-CC-PVDZ/JKFIT generated.  Number of basis functions:   1480 
 Basis set CC-PVDZ-F12/OPTRI generated.  Number of basis functions:   1100 
 Basis set AUG-CC-PVDZ/MP2FIT generated. Number of basis functions:   1186 

 Convergence thresholds:  THRVAR = 1.00D-08  THRDEN = 1.00D-06

 CCSD(T)     terms to be evaluated (factor= 1.000)


 Number of core orbitals:          12 (  12 )
 Number of closed-shell orbitals:  36 (  36 )
 Number of active  orbitals:        1 (   1 )
 Number of external orbitals:     437 ( 437 )
 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = =
 Memory manager status, default implementation STACK
 Heap status:    39 entries, memory used=88985 doubles
                           Type               Address    Size  Rank Bounds
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
                           double            36E9D040    1369     1  1:1369
                           double            36E9A570    1369     1  1:1369
                           double            36E97AA0    1369     1  1:1369
                           double            36E94FD0    1369     1  1:1369
                           double            36E92500    1369     1  1:1369
                           double            36E8FA30    1369     1  1:1369
                           integer           36E8A490    2738     1  1:2738
                           integer           36E84EF0    2738     1  1:2738
                           integer           36E82420    1369     1  1:1369
                           integer           36E7F950    1369     1  1:1369
                           integer           36E7CE80    1369     1  1:1369
                           integer           36E7A3B0    1369     1  1:1369
                           integer           36E778E0    1369     1  1:1369
                           integer           36E74E10    1369     1  1:1369
                           integer           36E72340    1369     1  1:1369
                           integer           36E6F870    1369     1  1:1369
                           integer           36E6CDA0    1369     1  1:1369
                           integer           36E6A2D0    1369     1  1:1369
                           integer           36E67800    1369     1  1:1369
                           integer           36E64D30    1369     1  1:1369
                           integer           36E62260    1369     1  1:1369
                           integer           36E5F790    1369     1  1:1369
                           integer           36E5CCC0    1369     1  1:1369
                           integer           36E5A1F0    1369     1  1:1369
                           integer           36E57720    1369     1  1:1369
                           integer           36E54C50    1369     1  1:1369
                           integer           36E52180    1369     1  1:1369
                           integer           36E4F6B0    1369     1  1:1369
                           integer           36E4CBE0    1369     1  1:1369
                           integer           36E4A110    1369     1  1:1369
                           integer           3605B250    1369     1  1:1369
                           integer           36058780    1369     1  1:1369
                           integer           36D53B20    1369     1  1:1369
                           integer           36E3CB20    6845     2  1:5  1:1369
                           integer           36E2F530    6845     2  1:5  1:1369
                           integer           36E21F40    6845     2  1:5  1:1369
                           integer           36E14950    6845     2  1:5  1:1369
                           integer           36E07360    6845     2  1:5  1:1369
                           integer           36DF9D70    6845     2  1:5  1:1369
 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = =
 Stack status: Remaining memory=215251401 doubles (784748599 currently used, 1000000000 maximum used), Entries=23
                           Type        Depth            Address      Size  Rank Bounds
 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
                          double   261436561       7F147D44ED40  ********     1  1:261436561
                          double   522873122       7F14009B48B8  ********     1  1:261436561
                          double   784309683       7F1383F1A430  ********     1  1:261436561
                          integer  784311052       7F1383F17968      1369     1  1:1369
                          integer  784312421       7F1383F14EA0      1369     1  1:1369
                          integer  784313790       7F1383F123D8      1369     1  1:1369
                          integer  784315159       7F1383F0F910      1369     1  1:1369
                          integer  784316528       7F1383F0CE48      1369     1  1:1369
                          integer  784317897       7F1383F0A380      1369     1  1:1369
                          integer  784319266       7F1383F078B8      1369     1  1:1369
                          double   784335435       7F1383EE7F70     16169     1  1:16169
                          double   784351604       7F1383EC8628     16169     1  1:16169
                          double   784352041       7F1383EC7880       437     1  1:437
                          double   784352478       7F1383EC6AD8       437     1  1:437
                          double   784352515       7F1383EC69B0        37     1  1:37
                          double   784352552       7F1383EC6888        37     1  1:37
                          double   784543521       7F1383D518C0    190969     1  1:190969
                          double   784734490       7F1383BDC8F8    190969     1  1:190969
                          double   784735859       7F1383BD9E30      1369     1  1:1369
                          double   784737228       7F1383BD7368      1369     1  1:1369
                          double   784748476       7F1383BC13E8     11248     1  1:11248
                          double   784748550       7F1383BC1198        74     1  1:74
                          integer  784748599       7F1383BC1010        49     1  1:49
 = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = = =
 ? Error
 ? Insufficient memory to allocate a new array of length 261436561 8-byte words
 ? The problem occurs in memory

 GLOBAL ERROR fehler on processor   0                                         
**********

Hans-Joachim Werner

belum dibaca,
18 Mei 2021, 03.12.3418/05/21
kepadaKristian Holten Møller, molpro-user, Qianli Ma
Please use -m to specify the stack memory per process. CCSD(T)-F12 needs little GA space and it is probably not necessary to give -G.
The -M option is mainly meant for density fitting and PNO calculations and seems not be sensible for standard CC calculations.
Sorry about this, we will revise it in future releases.

Joachim Werner

---
Prof. Dr. Hans-Joachim Werner
Institut für Theoretische Chemie
Universität Stuttgart
Pfaffenwaldring 55
70569 Stuttgart, Germany
e-mail: wer...@theochem.uni-stuttgart.de
> --
> You received this message because you are subscribed to the Google Groups "molpro-user" group.
> To unsubscribe from this group and stop receiving emails from it, send an email to molpro-user...@googlegroups.com.
> To view this discussion on the web, visit https://groups.google.com/d/msgid/molpro-user/9fab5c86-a3ae-42d6-8e2e-d853198e4ae2n%40googlegroups.com.

Kristian Holten Møller

belum dibaca,
18 Mei 2021, 03.29.4218/05/21
kepadaHans-Joachim Werner, molpro-user, Qianli Ma
Ahh, okay, I thought the "-M" option took that into account.
Thanks a lot for the clarification, I will do that.

Best,
Kristian H. Møller
Postdoc

Balas ke semua
Balas ke penulis
Teruskan
0 pesan baru