Special Issue: The Ecological Niche as a Window to Biodiversity

[Raquel Ubach]

Hola gente,

q tal andamos?? Por aquí ando haciendo mis primeros pinitos con R. Sé que Blas estaria orgulloso, jeje.

Os paso el enlace al "special issue" de la revista Journal of Biogeography recopilando distintos estudios sobre nichos ecológicos.
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/jbi.2012.39.issue-12/issuetoc

Os invito a utilizar el grupo para compartir vuestras publicaciones con el resto y así nos mantenemos al día y sabemos en qué temas anda metido cada uno. Por mi parte debo decir que de modelización más bien nada en mi trabajo diario. El mes pasado organizamos un Dialogue Café con expertos europeos sobre Salud y Calidad de Vida en las Ciudades. Mi contribución se centra más en la parte de la Green Infrastructure que está ahora tan de moda, pero ya os digo, modelización cero.

Bueno, espero que el recopilatorio os sea de interés. Un fuerte abrazo desde Barcelona!

Raquel.

 

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Raquel Ubach

GIS and Environmental Analyst

European Topic Center on Spatial Information and Analysis

Universitat Autonoma de Barcelona


+34 93 581 38 68  Direct phone

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[Blas Benito]

Hola Raquel, me alegra leerte! 

Sí, estoy orgulloso. Esto tiene que acabar en el CV en algo como "hablo inglés, francés, alemán, y R" :)

Muchas gracias por este special issue sobre nichos ecológicos. Yo había leído alguno de los artículos, pero no sabía que pertenecían a un número dedicado a esta disciplina.

Que no estés trabajando en modelización no tiene la menor importancia, cuando estás trabajando en un tema tan interesante como las Green Infrastructures :). Nosotros ahora estamos iniciando un trabajo relacionado con eso, evaluando la funcionalidad del corredor mesoamericano, con métodos que nada tienen que ver con los modelos de distribución.

Un beso, y que todo siga muy bien!

Blas

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Dr. Blas M. Benito
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Department of Ecology
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@blasmbenito
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[José Manuel González]

Hola Raquel,

Gracias como siempre por mantener vivo el foro. Adjunto os envío un pdf con un poster que presente en un congreso hace poco y otro pdf muy muy interesante (es un paper con scripps para un monton de tecnicas de modelización). La idea era presentarlo en plan publicación en el numero especial (sobre el congreso) del Journal of Sea Reseach que van a sacar en Diciembre, pero me he tenido que pirar a Escocia por temas de trabajo y de momento no va a poder ser. En mi actual trabajo yo tampoco estoy haciendo nada de modelización del nicho ecológico por el momento, pero estoy seguro de que llegará por lo que estoy muy interesado en seguir conectado al foro. Gran parte de los scripps que he usado se basan en los que me paso un coleguita que hizo el curso un year despues (no quiero poner year en spanish con n, jejejej), si a Blas no le importa y estais interesados puedo mandaroslos. Ahora mismo para mí el mayor reto es la comparación entre modelos porque las curvas AUC se me quedan un poco flojas la verdad.  

UN saludo desde Aberdeen. 

Cye  

[José Manuel González]

Ahora el otro pdf (no os he mandado los dos juntos porque igual era mucho mega pa el body).

Nos vemos

---------- Mensaje reenviado ----------
De: José Manuel González <gonzale...@gmail.com>
Fecha: 21 de noviembre de 2012 11:09
Asunto: Re: [mod_ecol] Special Issue: The Ecological Niche as a Window to Biodiversity
Para: modelizacion-ni...@googlegroups.com

[Laura Martín]

Gracias Raquel, eres el alma del grupo!! En breve les pasaremos un trabajo que me han aceptado.

Un abrazo a todos.

Laura.

[Blas Benito]

Hola José Manuel,

El póster está fantástico! Es una pena que no puedas preparar el trabajo para el Journal of Sea Research (con suerte entrará uno en el que participo sobre la distribución de Zostera marina). Espero poder ver el tuyo publicado en algún momento!.

Sobre el material del año pasado, como siempre, está colgado en el blog, (y en la página de GBIF):

http://siguiendoelcambio.blogspot.com.es/2012/05/material-del-curso-de-modelos-de.html

Y sí, en parte está basado en el pdf de Elith e Hijmans que adjuntas, que es muy bueno (librería Dismo en R).

Espero que te vaya MUY BIEN en tu nuevo destino.

Un abrazo

Blas

[Maialen Iturbide]

Hola!

Me parece genial Raquel!

Yo tembién estoy con R, aprendiendo y utilizándolo, hasta ahora solo para generar datos de evapotranspiración mediante diferentes funciones, esto me ha servido para aprender lo básico. Lo proximo es aprender a manejar datos espaciales y empezar a modelizar dejando a un lado "worldcim", para empezar con datos generados a partir de ENSEMBLES. Sigo con cambio climático y distribución de especies.

Hace mucho que no abro una hoja excel..aunque a veces me siento tentada...pero resistiré, porque la verdad es que R mola. Espero ser capaz de hacer algo decente utilizándolo.

Por el momento os puedo ofrecer manuales de R y un caso práctico de un curso de geoestadística que nos dió durante dos días A.F. Militino. Os dejo este enlace de dropbox en el caso de que queraís descargaros algo.

 https://www.dropbox.com/sh/bxp6cjmmhh6dbcz/zKBrFIhuUO

Un saludo a todos,

Maialen

2012/11/21 Blas Benito <blasb...@gmail.com>

[José Manuel González]

Gracias Blas!

No me acordaba de que colgaís el material en la web, esta muy bien saberlo para seguiros la pista. Me alegro de que te hayas decidido a dejar la montana por el mar, jejeje. Si al final publicais el paper de ZOostera, please mandanoslo.  

Un saludo, nos vemos. 

[Blas Benito]

Hombre, no he dejado la montaña! Esto solo es una incursión como invitado.

[Cristina Villaverde]

Hola a todos:

Creo que ya os avisé, pero por si acaso, os recuerdo que todos los materiales del curso, incluidos los VIDEOS, están disponibles en la página web: http://www.gbif.es/formaciondetalles.php?IDForm=96#descargas

 

Saludos a todos.

Cristina

 

Cristina Villaverde

GBIF.ES, Unidad de Coordinación         Tel. +34 91 4203017 x 273
Real Jardín Botánico - CSIC                     Fax +34 91 429 2405
Plaza de Murillo, 2                                   villa...@gbif.es
28014 Madrid, Spain                               www.gbif.es

 

De: modelizacion-ni...@googlegroups.com [mailto:modelizacion-ni...@googlegroups.com] En nombre de Blas Benito
Enviado el: miércoles, 21 de noviembre de 2012 13:29
Para: modelizacion-ni...@googlegroups.com
Asunto: Re: [mod_ecol] Special Issue: The Ecological Niche as a Window to Biodiversity

 

Hombre, no he dejado la montaña! Esto solo es una incursión como invitado.

[Maialen Iturbide]

Hola a todos!

Aunque ha pasado mucho tiempo, aprovecho la invitación que hizo Raquel de compartir en este foro las publicaciones de cada uno.

Hemos desarrollado el paquete de R "mopa", que genera pseudo-ausencias según los métodos descritos en el artículo que acaba de publicarse en Ecological Modelling "A framework for species distribution modelling with improved pseudo-absence generation". También contiene funciones para realizar modelizaciones con diferentes algoritmos y datos para practicar con los mismos.
Junto al paper se publica material suplementario (Apendix. B) que consiste en un tutorial sobre la instalación y uso de "mopa". El acceso libre al paper es hasta el 30 de Julio a través del siguiente link:
http://authors.elsevier.com/a/1RAcp_6wxcH60t

Espero que os interese y que "mopa" os resulte útil.

Escribidme si decidís utilizarlo y tenéis cualquier duda.

Un abrazo a todos,

Maialen Iturbide

[Laura Martín]

Muchísimas gracias!!! Lo leeré con calma!!

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Laura Martín
Universidad de La Laguna

Avda. Astrofísico Francisco Sánchez s/n

CP38205 La Laguna

S/C de  Tenerife

España

Correo electrónico: lmar...@ull.edu.es
lagal...@gmail.com

[Blas M. Benito]

Enhorabuena Maialen!!!

Estupendo artículo, gracias por compartirlo!

Un abrazo,

Blas

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Blas M. Benito

Postdoctoral researcher at:

Centre for Biocultural History (http://bioculture.au.dk)

Ecoinformatics and Biodiversity (http://bios.au.dk/en/about-bioscience/organisation/ecoinformatics-and-biodiversity/)

Contact:

email: blas....@biology.au.dk / blasb...@gmail.com

webpage: www.blasbenito.net

twitter: @blasmbenito

skype: blasbp

phone: 0045 26832676