Infelizmente nunca ouvi dizer sobre consertar leitor de Cartão SD manualmente.
E não imagino quanto a autorizada cobraria para fazer isso (acredito que sua garantia já tenha acabado, se possui o aparelho faz tempo).
A única experiência do tipo que tive foi com uma câmera digital Kodak que comprei e deu defeito no leitor no segundo dia de uso. Como era recente, fui na loja mesmo, briguei por um tempão provando que o problema era na câmera e não nos 3 cartões que usei pra testar na frente do gerente e consegui trocar por outra ali mesmo.
Mas sendo seu Milestone já antigo, que tal aproveitar que vai gastar e comprar outro aparelho? Hehehe, é triste, mas é uma boa opção.