Это очень сильно зависит от назначения механизма. Простейший
демонстрационный вариант можно бесплатно самому выпилить лобзиком из
фанеры, и он будет нормально работать. Для сложных задач дерево может
не подойти из-за своих свойств.
В любых механизмах неидеальность приводит к повышенному трению вплоть
до заеданий или к люфтам вплоть до перекосов деталей. Причем одно
другого не исключает, и в плохо сделанных механизмах люфты и заедания
присутствуют одновременно. При работе с деревом главная проблема - это
нестабильность самого дерева, что сильно ограничивает возможную
точность конструкции.
С круглыми дисками работать будет плохо, потому что диски из дерева
никогда не будут достаточно круглыми. Да и не из дерева тоже. Нужна
токарная обработка и хороший материал (не хуже алюминия 6061, лучше
сталь). Но нет особых проблем сделать шестеренки, только надо на
профиль зубцов внимание обратить.