Pelos testes que já fiz, percebi que o arquivo php que gera o gráfico se comporta exatamente como um JPG. Provavelmente o mesmoproblema aconteceria com uma imagem jpg qualquer. Tente testar com uma imagem estática qualquer pra ver se acontece o mesmo (creio que com a imagem não funcionará também, se eu estiver certo o problema não é com o arquivo php). Caso a imagem estática também não apareça, provavelmente o erro está na geração do pdf, dai após corrigir o problema da geração do pdf, é só substituir a imagem estática utilizada como exemplo para a imagem gerada dinamicamente pelo PHPLote.
Se não conseguir me envie o código pra eu ver se consigo identificar o problema. Mas por favor, coloque todos os comentários que ajudem esclarecer o código e todas as dependências para que eu possa testar.