Bueno, dejo un par de ideas para ir discutiendo:
Aparte de cosas como el foro y la wiki, que tienen su propia estructura donde poco hay para cambiar, yo creo a la página principal podríamos darle un enfoque "panóptico", es decir, que no sólo se vea el último artículo sino que se vean varios, quizás organizados en secciones, algún slide o una forma de destacar contenidos de forma atractiva, banners a secciones nuestras que queramos destacar también, etc.
Algunos ejemplos, de los que os invito a fijaros en la estructura que tienen en común (no en el diseño en concreto, colores, etc. que eso se cambia) serían:
http://drupal2u.com/2011/02/school-free-drupal-7-template/
http://drupal2u.com/2011/02/jd-purity-free-drupal-template/http://drupal2u.com/2011/02/life-care-free-drupal-theme/
http://drupal2u.com/2011/02/jackson-free-drupal-template/Claro que no haría falta hacer algo así desde el principio, y tampoco pasarse a recargar las cosas, pero creo que es importante que en un futuro se pueda percibir de un vistazo (y cuanto más gráficamente mejor) la variedad de contenidos que hay (o habrá, jeje) en la web.
¡Saludos!
Jorge