mTBI_Off_Med2 <- '
#Wave 1 LV’s
# IM_W1
IM_W1 =~ NA* IM1_W1 + IM2_W1 + IM3_W1 + IM4_W1 + IM5_W1
IM_W1 ~~ 1* IM_W1
IM1_W1 ~~ IM2_W1
IM2_W1 ~~ IM5_W1
IM3_W1 ~~ IM5_W1
#AD_W1
AD_W1 =~ NA* AD1_W1 + AD2_W1 + AD3_W1 + AD4_W1 + AD5_W1 + AD6_W1 + AD7 _W1 + AD8_W1 + AD9 _W1 + AD10_W1 + AD11_W1 + AD12_W1 + AD13_W1 + AD14_W1
AD_W1 ~~ 1* AD_W1
AD1_W1 ~~ AD2_W1 + AD6_W1 + AD7_W1 + AD11_W1
AD3_W1 ~~ AD4_W1 + AD7_W1 + AD8_W1 + AD10_W1 + AD14_W1
AD4_W1 ~~ AD9_W1
AD5_W1 ~~ AD2_W1 + AD4_W1
AD6_W1 ~~ AD7_W1
AD8_W1 ~~ AD4_W1 + AD5_W1 + AD9_W1 + AD10_W1
AD11_W1 ~~ AD12_W1
AD10_W1 ~~ AD9_W1 + AD12_W1 + AD13_W1
AD13_W1 ~~ AD4_W1 + AD12_W1
ASB_CUT_W1 =~ NA* CU1_W1 + CU2_W1 + CU3_W1 + CU4_W1 + ASB1_W1 + ASB2_W1 + ASB3_W1 + ASB4_W1 + ASB5_W1 + ASB6_W1 + ASB7_W1 + ASB8_W1 + ASB9_W1 + ASB10_W1
ASB_CUT_W1 ~~ 1* ASB_CUT_W1
ASB2_W1 ~~ ASB1_W1 + ASB4_W1 + ASB8_W1 + ASB10_W1 + CU1_W1
ASB3_W1 ~~ ASB2_W1 + ASB8_W1 + ASB10_W1 + CU1_W1
ASB4_W1 ~~ ASB5_W1
ASB8_W1 ~~ ASB6_W1 + ASB9_W1 + ASB10_W1 + CU1_W1
CU2_W1 ~~ ASB1_W1 + ASB6_W1 + ASB9_W1 + CU1_W1
CU3_W1 ~~ ASB2_W1 + ASB3_W1 + ASB8_W1 + ASB10_W1 + CU1_W1 + CU4_W1
CU4_W1 ~~ ASB1_W1 + ASB3_W1 + ASB10_W1 + ASB2_W1
#Based on MI
IM1_W1 ~~ IM3_W1 + ASB1_W1 + ASB2_W1 + AD7_W1 + AD14_W1
IM2_W1 ~~ IM4_W1 + AD3_W1 + AD5_W1 + AD9_W1 + AD10_W1 + AD12_W1 + AD14_W1 + ASB4_W1 + ASB7_W1 + ASB2_W1 + ASB1_W1
IM3_W1 ~~ ASB2_W1 + AD13_W1 + CU2_W1
IM4_W1 ~~ IM5_W1 + AD3_W1 + AD4_W1 + AD5_W1 + ASB1_W1 + ASB5_W1 + ASB6_W1 + AD1_W1 + AD8_W1 + AD10_W1 + AD9_W1 + CU2_W1 + AD13_W1
IM5_W1 ~~ ASB2_W1 + AD12_W1 + AD14_W1
AD2_W1 ~~ ASB7_W1 + AD8_W1
AD1_W1 ~~ ASB4_W1
AD3_W1 ~~ CU1_W1 + CU2_W1 + AD5_W1 + ASB10_W1 + CU3_W1
AD4_W1 ~~ ASB7_W1 + CU2_W1
AD5_W1 ~~ CU2_W1 + ASB1_W1 + ASB3_W1 + ASB4_W1 + ASB6_W1 + ASB5_W1 + ASB7_W1 + ASB8_W1 + ASB9_W1
AD11_W1 ~~ AD6_W1 + AD7_W1 + ASB10_W1
AD8_W1 ~~ ASB1_W1 + ASB4_W1 + ASB7_W1 + CU2_W1
AD7_W1 ~~ ASB1_W1 + ASB7_W1
AD9_W1 ~~ ASB2_W1 + ASB3_W1+ ASB10_W1
AD10_W1 ~~ AD11_W1 + ASB9_W1 + ASB10_W1
AD12_W1 ~~ ASB3_W1 + ASB8_W1
AD13_W1 ~~ CU2_W1 + ASB4_W1 + ASB6_W1
AD14_W1 ~~ AD12_W1+ ASB1_W1 + ASB8_W1
ASB5_W1 ~~ ASB9_W1
ASB3_W1 ~~ ASB9_W1
#Wave 2 LV’s
#IM_W2
IM_W2 =~ NA* IM1_W2 + IM2_W2 + IM3_W2 + IM4_W2 + IM5_W2
IM_W2 ~~ 1* IM_W2
IM2_W2 ~~ IM4_W2
IM1_W2 ~~ IM4_W2
#AD_W2
AD_W2 =~ NA* AD1_W2 + AD2_W2 + AD3_W2 + AD4_W2 + AD5_W2 + AD6_W2 + AD7_W2 + AD8_W2 + AD9_W2 + AD10_W2 + AD11_W2 + AD12_W2 + AD13_W2 + AD14_W2
AD_W2 ~~ 1* AD_W2
AD2_W2 ~~ AD1_W2 + AD11_W2
AD3_W2 ~~ AD4_W2 + AD10_W2 + AD14_W2
AD4_W2 ~~ AD5_W2
AD7_W2 ~~ AD6_W2 + AD12_W2 + AD14_W2
AD8_W2 ~~ AD4_W2 + AD9_W2 + AD10_W2
AD9_W2 ~~ AD10_W2 + AD13_W2
AD12_W2 ~~ AD14_W2
#ASB_CUT_W2
ASB_CUT_W2 =~ NA* CU1_W2 + CU2_W2 + CU3_W2 + CU4_W2 + ASB1_W2 + ASB2_W2 + ASB3_W2 + ASB4_W2 + ASB5_W2 + ASB6_W2 + ASB7_W2 + ASB8_W2 + ASB9_W2 + ASB10_W2
ASB_CUT_W2 ~~ 1* ASB_CUT_W2
CU1_W2 ~~ CU4_W2
CU2_W2 ~~ CU1_W2 + CU3_W2 + CU4_W2 + ASB9_W2
CU3_W2 ~~ CU1_W2 + CU4_W2
ASB2_W2 ~~ ASB1_W2 + ASB4_W2
ASB5_W2 ~~ ASB9_W2
ASB6_W2 ~~ ASB3_W2 + ASB7_W2 + ASB8_W2 + ASB10_W2
ASB7_W2 ~~ ASB3_W2 + ASB4_W2 + ASB3_W2 + ASB10_W2
#based on MI
IM1_W2 ~~ IM3_W2 + IM2_W2 + ASB2_W2
IM2_W2 ~~ AD3_W2 + AD10_W2 + AD14_W2
IM3_W2 ~~ AD4_W2
IM4_W2 ~~ AD3_W2 + AD4_W2 + AD6_W2 + ASB6_W2
IM5_W2 ~~ IM3_W2 + AD5_W2
ASB2_W2 ~~ ASB5_W2
ASB3_W2 ~~ AD3_W2 + AD9_W2
AD3_W2 ~~ CU2_W2
AD7_W2 ~~ AD8_W2 + CU1_W2
AD12_W2 ~~ ASB9_W2
AD14_W2 ~~ AD11_W2 + ASB2_W2 + ASB8_W2
ASB7_W2 ~~ AD4_W2 + AD5_W2 + AD7_W2 + AD8_W2
#correlate LV’s W2
IM_W2 ~~ c* AD_W2 + ASB_CUT_W2
AD_W2 ~~ ASB_CUT_W2
#correlate LV’s W1
IM_W1 ~~ c* AD_W1 + ASB_CUT_W1
AD_W1 ~~ ASB_CUT_W1
#Regression paths
#direct effects
NVtot_log ~ C1 * HI_Bi_B21
VOtot_log ~ C2 * HI_Bi_B21
#Mediation: A paths
IM_W2 ~ A1 * HI_Bi_B21
AD_W2 ~ A2 * HI_Bi_B21
ASB_CUT_W2 ~ A3* HI_Bi_B21
#Mediation: B paths
NVtot_log ~ B1_1 * IM_W2
NVtot_log ~ B2_1 * AD_W2
NVtot_log ~ B3_1 * ASB_CUT_W2
VOtot_log ~ B1_2 * IM_W2
VOtot_log ~ B2_2 * AD_W2
VOtot_log ~ B3_2 * ASB_CUT_W2
#Effect estimates
indirect1_1 := A1 * B1_1
indirect2_1 := A2 * B2_1
indirect3_1 := A3 * B3_1
indirect1_2 := A1 * B1_2
indirect2_2 := A2 * B2_2
indirect3_2 := A3 * B3_2
total1_1 := C1 + (A1 * B1_1)
total2_1 := C1 + (A2 * B2_1)
total3_1 := C1 + (A3 * B3_1)
total1_2 := C2 + (A1 * B1_2)
total2_2 := C2 + (A2 * B2_2)
total3_2 := C2 + (A3 * B3_2)
#control paths: W1 LV’s
IM_W2 ~ IM_W1
AD_W2 ~ AD_W1
ASB_CUT_W2 ~ ASB_CUT_W1
NVtot_log ~ IM_W1 + AD_W1 + ASB_CUT_W1
VOtot_log ~ IM_W1 + AD_W1 + ASB_CUT_W1
#control paths: other vars
IM_W2 ~ Age_W3 + Sex + Ethnicity + Neighborhood_SES + PC_EDU
AD_W2 ~ Age_W3 + Sex + Ethnicity + Neighborhood_SES + PC_EDU
ASB_CUT_W2 ~ Age_W3 + Sex + Ethnicity + Neighborhood_SES + PC_EDU
NVtot_log ~ Age_W3 + Sex + Ethnicity + Neighborhood_SES + PC_EDU
VOtot_log ~ Age_W3 + Sex + Ethnicity + Neighborhood_SES + PC_EDU'