Hola Lizeth,
No hay mucha información al respecto del tipo de modelización que estas haciendo pero las calibraciones manuales desde ArcSWAT normalmente no son muy útiles debido a la complejidad de los procesos a nivel de cuenca hidrográfica. Por eso se hacen con otras alternativas como Python, R, o con SWAT-CUP, esta ultima herramienta como una de las más utilizadas.
Sobre los escenarios de cambio climático, puedes hacerlo de dos maneras:
1). Generando unas variaciones sobre las variables mes a mes durante el periodo de simulación. Esto lo puedes hacer en editar estaciones desde el ArcSWAT e introducir manualmente las variaciones si las tienes. Esto se suele hace cuando tiens valores incrementales o decrecientes de los escenarios del IPCC según el RCP que quieras evaluar. le darias volver a leer las bases de datos y volver a correr para el mismo periodo de tiempo.
2). Generar unas bases de datos de clima nuevas. para ello deberias volver a cargar las estaciones de clima con los nuevos datos. Podrias seguir el siguiente video que te da una idea de como hacerlo.
Por ultimo, tienes que saber que no hay una única solución parta la calibración, puede haber varias. Yo te recomendaria que tomaras del SWAT_CUP al menos las mejores 10 combinaciones de parámetros que dieron mejores resultados en la calibración para que cuando hagas estos 10 intentos con los datos de clima tengas un rango de posibilidades y no un solo valor de los escenarios de cambio climático.
Creo que no tienes claro el concepto de calibración. La calibración se hace viendo el valor simulado comparado con un valor observado (medido) en campo. Si haces escenarios futuros...¿cómo vas a medir algo que sucede en el futuro, si aún no sucede?.....por lo tanto los escenarios de cambio climático son una "posible" aproximación y NO SE PUEDEN CALIBRAR. Lo que puedes hacer es como mencione arriba, utilizar las mejores combinaciones de parámetros de la calibración para evaluar las variaciones climaticas y ver las respuestas del modelo actual con respecto a ese grupo de simulaciones.
espero sea de ayuda, si las dudas persisten vuelve a escribir!
David