o que voce pode fazer para que a numeração do enumerate fique acima é baixar a posição da árvore (que geralmente fica na parte inferior da figura, por isso a numeração fica nivelada com a parte inferior).
\raisebox{distance}[extend-above][extend-below]{<a sua árvore>}
onde <a sua árvore> é o ambiente \begin{tikzpicture}.....\end{tikzpicture}
distance: valor positivo sobe a figura, negativo, desce a posição da imagem.
\begin{enumerate}
\item \raisebox{-30mm} {
\begin{tikzpicture}
.....
\end{tikzpicture}
}
\end{enumerate}