Certo vamos la:
Meu arquivo matriz e esse aqui:
\documentclass[fancyheadings, fancychapter, sureport]{Classes/PPGMCTI}
\ifpdf
\hypersetup{backref,
colorlinks = true,
pdftitle = Titulo da dissertação ou tese,
pdfsubject = Mestre/Doutor em MCTI,
pdfcreator = Subtitulo,
pdfproducer = PDFLatex,
pdfkeywords = {Palavra-chave1, Palavra-chave2, Palavra-chave3}
}
\fi
\usepackage{longtable}
\usepackage{lipsum}
\usepackage{multirow}
\usepackage{lscape}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{float,subfigure}
\usepackage[left=3cm,top=3cm,right=2cm,bottom=2cm]{geometry}
\usepackage[alf]{abntex2cite}
\usepackage{algorithm}
\usepackage{algorithmic}
\usepackage{ifpdf}
\setlength{\LTcapwidth}{\textwidth}
\begin{document}
%%----------------------------------------------------------------------------
%% Define the title page
%%----------------------------------------------------------------------------
\university{UNIFACS}
% \faculty{Pro\-gra\-ma de P\'os-gra\-dua\-\c{c}\~ao em Mo\-de\-la\-gem Com\-pu\-ta\-cio\-nal e Tec\-no\-lo\-gia In\-dus\-trial}
\faculty{Pro\-gra\-ma de Pós-gra\-dua\-ção em E\-ner\-gia}
% \school{School of Mathematics}
\course{Mestrado em Energia}
\typework{Disserta\c{c}\~ao de mestrado}
% \typework{Tese de doutorado}
% \course{Doutorado em Modelagem Computacional e Tecnologia Industrial}
\thesistitle{Gestão de Portfólio em Geração baseado na Maturidade de Externalidades Ambientais}
\hidevolume
\thesisvolume{Volume 1 of 1}
\thesisauthor{Alessandro Marques}
\thesisadvisor{José Ângelo}
\hidecoadvisor
\thesiscoadvisor{Miguel Angel Rivera Castro}
\thesisdegreetitle{Mestre em Energia}
% \thesisdegreetitle{Doutor em Modelagem Computacional e Tecnologia Industrial}
% \thesismonthyear{M\^es de Ano}
\thesismonthyear{Junho de 2014}
\maketitlepage
%%----------------------------------------------------------------------------
%% Inserir Folha de rosto, Nota de estilo, folha de assinaturas, dedicatoria
%%----------------------------------------------------------------------------
\include{Others/FolhaRosto}
\include{Others/NotaEstilo}
\include{Others/FolhaAssinaturas}
\include{Others/dedicatoria}
\include{Others/agradecimentos}
%%%-------------------------------------------------------------------------------
\begin{romanpagenumbers}
\include{Others/resumo}
\include{Others/abstract}
% Make list of contents, tables and figures
\thesiscontents
%Include other required section
\include{Others/abbreviation}
%Switch the page numbering back to the default format
\end{romanpagenumbers}
%%----------------------------------------------------------------------------
%% Include thesis chapters
%%----------------------------------------------------------------------------
\parskip=\baselineskip
\include{Chapters/ChapterOne}
\include{Chapters/ChapterTwo}
\include{Chapters/ChapterThree}
%\include{Chapters/ChapterFour}
%\include{Chapters/ChapterFive}
%\include{Chapters/ChapterSix}
%\include{Chapters/ChapterSeven}
%\include{Chapters/ChapterEight}
\include{Chapters/ChapterConsideracoesfinais}
% include more chapters ...
%%----------------------------------------------------------------------------
%% Include thesis appendices
%%----------------------------------------------------------------------------
Porem o que ocorre.
Nos capítulos, os acentos sao tratados normalmente, porem nos %% Resumo/abstract, sumário e siglas nao consigo escrever com acentos que nao roda...
ja tentei de tudo e nada de conseguir.