Olá,
fiz testes com a CEF, usando carteira registrada. O que propuseram do mecanismo registro ser uma base unica e bla bla bla bla, isso na realidade não funciona ainda. Ou seja, você pode gerar boleto, cliente paga o boleto e normalmente sem nenhum problema, mesmo você não enviando remessa.
Fiz esse teste com 5 bancos, gerei 5 boletos distintos, paguei um na própria agencia CEF, Loterica, BB, ITAU e Bradesco , ambos receberam os boletos.
Unica coisa que notei, é que no programa da caixa que uso, ecobranca, esses boletos que não gerou remessa não aparecerá na listagem de títulos la na base deles, mas nada impede do cliente efetuar pagamento.
Então resumindo, enviando ou não a remessa, os boletos vão ser aceitos normalmente, isso de acordo os meus testes com a CEF, não sei os outros bancos.
Olhando por esse lado, estou preferindo n gerar remessa, pois ai posso atualizar os boletos para clientes sem pagar taxa de alteração rsrsrs.